ISAba60

  • Family IS5
  • Group IS427
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
ND Acinetobacter baumannii
Acinetobacter baumannii
Acinetobacter baumannii LUH6050
Acinetobacter piscicola YH12207_T
Acinetobacter sp. YH12138
DNA section
IS Length : 857 bp

Ends


IR Length : 15/16

IRL : GGGTCTGTTGACATTTGTTGATTAAAAAAATAGCGAGATAGTAAAATTAA
IRR : GGGTGTGTTGACATTTACAGCCGATAAATTGAGCTAAAGAGGCAACCATA

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
AAAGAGATTAATAATACT2

DNA sequence

GGGTCTGTTGACATTTGTTGATTAAAAAAATAGCGAGATAGTAAAATTAAATCGCCAAACCCAATTTTACACTCGCTATGCCTCGAACAATGCTAAATGA
TCAACACTGGTCCAAGTTACTTGCTATTTTCCGTCACTTTAATATTTATCTCAAATTAAATTTACGGAATTTTATTGAAGCGATTTTATTTCGAATTAGA
ACAGGCTGTCCTTGGCGTGATTTACCTCAAGAGTTTGGTAAATCAAATTCTATTTTTAAGAAATATAATCGATGGTCTAAAAATAGTAAGTTTATGAATA
TTTTTAAATTATTCAGCCAGCATGCTGATAAAGAGTGGATTTTTATCGATGGGAGCCATGTACGAGCGCATCAACATTCAGCTGGTATTAAGAATCAAAG
TATTTCCAAAAGTATTGGTGGTAATAGTTCAAAAATACATTTAGCAATCGATTCAAATGGTAATCCTATTGAATTTATTATTTCAGATGGAACTTCACAT
GATATTAAGGTTGCACCTGATCTTGTATCAAAATTAGATTTAACAGAGTCAGAAATGCTATGTGCAGATAAAGGCTATGATTCAGAAAGTTTCAGAAAGA
AAATTAGAGAAAGTAATACGAAAGCAAACATTCCTCGAAGATCAAATGCCAAATCTAGCAATGATGATATGGACTGGTATATGTATAAAATCAGACATTT
AGTTGAAAATGCATTTTGTAGATTAAAACAATTTAGAGGAATTGCCACAAGATACGATAAGCTAAAACGTAACTATCAAAGCGCTGTTGCTTTAGCTTGT
ATATTTATATGGTTGCCTCTTTAGCTCAATTTATCGGCTGTAAATGTCAACACACCC
Protein section
ORF number : 1

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
747 bp248 aa78824+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MPRTMLNDQHWSKLLAIFRHFNIYLKLNLRNFIEAILFRIRTGCPWRDLPQEFGKSNSIFKKYNRWSKNSKFMNIFKLFSQHADKEWIFIDGSHVRAHQH
SAGIKNQSISKSIGGNSSKIHLAIDSNGNPIEFIISDGTSHDIKVAPDLVSKLDLTESEMLCADKGYDSESFRKKIRESNTKANIPRRSNAKSSNDDMDW
YMYKIRHLVENAFCRLKQFRGIATRYDKLKRNYQSAVALACIFIWLPL

 

Blast result :
Comments
ISAba60 is 89% aa similar to ISAlw11.
References
1] Ambrose SJ. and Hall RM. (2021) Direct submission