ISHp1
- Family IS1595
- Group ISPna2
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
CP011484 | ND | Helicobacter pylori | Helicobacter pylori CC33C |
DNA section
IS Length : 4405 bp
Ends
IR Length : 26/27
IRL : GGCTCTATTTGTAAAAAGTGTTGATTTTTAATAGTTATTTTGCTAAAATA
IRR : GGCTCTATTTGTAAAAAGTATTGATTTGTTCATATTATCTGTTTTTATAC
Insertion site
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---|---|---|---|
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DNA sequence
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Protein section
ORF number : 2
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
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Chemistry : DDE
ORF sequence :
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Blast result :ORF 2
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
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3273 bp | 1090 aa | 1099 | 4371 | + | No |
Annotation : N-6 DNA MethylaseDescription :
ORF sequence :
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Blast result :
Comments
ISHp1 is 81% (transposase) aa similar to ISCaje5.
References
1] ISfinder annotation (2017)
2] Montano,V., Didelot,X., Foll,M., Linz,B., Reinhardt,R., Suerbaum,S., Moodley,Y. and Jensen,J.D. (2014) Direct GenBank submission.
2] Montano,V., Didelot,X., Foll,M., Linz,B., Reinhardt,R., Suerbaum,S., Moodley,Y. and Jensen,J.D. (2014) Direct GenBank submission.