ISEisp1
- Family IS1595
- Group ISPna2
Isoform Synonym(s)
| Accession number | Transposition | Origin | Host |
|---|---|---|---|
| LXSR01000015 | ND | Eikenella sp. | Eikenella sp. NML96-A-049 |
DNA section
IS Length : 4713 bp
Ends
IR Length : 25
IRL : GGCTGTGTTTTAAGATACTGTTGATATAGTTACCCAATTCTGGTATAATC
IRR : GGCTGTGTTTTAAGATACTGTTGATCTGTAAAGATTAGGTTGTATCTAAT
Insertion site
| Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
|---|---|---|---|
| AGGTAGCCTTCATCCCTA | TTTGAAA | AAGGGCGGATTAGTA | 8 |
DNA sequence
GGCTGTGTTTTAAGATACTGTTGATATAGTTACCCAATTCTGGTATAATCCCTATACACTCAGATGGTTATAGGGATTTTGTTTTATGAAAATCACTCAC
GATATTGATGTACTTAAGCAACTCTTTGAAAATCTTTCCGATACAGACAAGCAACAGTTTCTAAGTGAAATTGCAAGCAGCAAAGCTACGATTCAAAAGG
TTATTCAACCAAGAGAAGTGAAAACCTGTCCACATTGCCAATCTACTCATTTTGTGAAAAATGGCAAAGCAAATAGCAATCAACGTTATTTATGTAAAGC
GTGCCGTAAAACTTTTGTAGAACAAACTGGTACTATATTATTTAGTATGAAAAAAGATATTTCCGTATTGGAAAAGTATGTTCATTGTATGATCGAAAAA
TACCCACTCCGAAAATGTGCGGAAATTTGCGACATCAACTTGGCAACCGCTTTTGCTTGGCGACATAAAATCTTAGATGCTCTGCAAAAAATGATGGAAC
AAGTAGAATTAGATGGTGTCGTGCAAGCTGACGAAACATTTACTACGATTTCATATAAAGGAAATCACAAAAATTTTAATTTACCACGTCCGCCGCATAA
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AAAAGATTTAATCTTTGGTACTTTCAAGGGTGTGGCAACAAAATATCTGAATAACTACATTGTTTATCATAATTTTGTGAACTTTGCAAAAGATACTAAA
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TAAAATGAATAAACAGATTTCTATTCAAGATATGCAAAATACGTTATTTGAAGGAGATTGTTTGGAGATTATGAGAAAATTTCCTGATAATTCTGTGGAT
ATGGTTTTATGCGACTTGCCTTATGGCACAACTCAGAATAAGTGGGATAGTGTAATAGATCTCAATTTATTATGGGAAGAATATAATAGAATTGTCAAGC
CTAGTGGAGCTATTATTTTAACTTCACAAGGTATATTTACAGCAAAATTAATTCTATCTAATGAAAAGAATTTCAAGTATAAAATTGTTTGGGAAAAATC
AAAGCCAACCAATTTTCTTAATGCTAAAAAACAACCCTTGCGAAAATATGAAGATATTTGTGTTTTTTATGAGAAGCAACCTACTTATAACCCGCAAATG
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GTACACAAATGAAAATGATCTTATTTTAGATAACACATTTGGAAGTGGAAGCTTTTTAGTTTCAGCCGCATTAGAAAATAGATATTTTTGTGGAATCGAA
AAAAATCAAAATGCTACGTTATTTAAAGGTAAACTCATTGATTATATTGATTTGGCTTTAGATAGATTGAATAAAATCGGTGCAAGCGTAAGGGTTGTAA
GATGAACACAGCAAAATTGAATTACAACGAACGAGCTTGGGGTATTGATGTAATTAGTCACATTAATTTATTTTGTTCTAAAAATAATCTTTTTGTAAAA
AAGCTGGTGGAGAGAGAACTTTAAAAGATAATAGTAAGAAAAATCTTTTTCCTGATGTTTTGTTATATGGAAATGAGAGGGTTGGTGAGGTTATTCAAGG
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TTTCTCACTACCTAAAAACATTCAACTCAAATGCTGAAATAATTAACGATCTAACTCCAAATTCATCGATTGATAATATTATAAGTACATTCGAAAAAAT
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TAAAAGAGATTAGATTTGAGAGAATAGATAGTAATTATTTGTATAATGTTATTGATTCTGCTTTATTGCATTCACGAAAGAAAGTTGTTGGACAATTTTC
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CTATTGCATTATTCAGATCCACAAGCATTAGGTAATCTTGTTCAAGTATTTCAAATGGATGTTTTTGAATTACAAACAAATTCTGAAATTTCCTTTGTAG
ATCCGTTTGTTGAGAAAATTGTAATAAAAGAACTACCAGTTATGCACGCTGTTGTTTCTAATCTACCATTTGTGAGATTTGAAACAGCAGAAATTCCTAA
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TAAGCCAGTTGTGATGAGTTCAAAAGATTTGCCTGATAATTTAATCTGGCAAGCAAAAAAAGAAGCATTTTGCTGTTCAGAACCTATTGAATCATTAAAA
GCAAAAAAACATTATGGTGCATTAGAATGGATTTCTAAATTTGAAAATGGTACAAATGAGAAAGGAAAACCACTCATTGAGTTTTTAAAACGGAACAATC
ATTTTTGGTACGAAATGAAACCAAATACTTTAGCTGATATGGTTATATCAATGAATCCCGATAAGAAAATATGTGTCTATCGACTTAAAGAACGTTCTTT
TGTTAATCAACGATTAATTAGTCTAGCTGTAAAAGATACAGAAAAATTAGATCTACTACATGCTTTATTAAATAGTGGGCTTTCATTATTTTATATTGAA
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AGGTTTCAGAAATAGTAGCTAAATTCCAATCTATTTTAAATAGCAATGTATTAGACCTTCCTAATGAATTACAGCAAGAAGACCGCATTGAATTTGATAG
GGCTGTACTAAATGCTTTTAATATCGAACTAGACCCTAAAACTATCTATGATAGTTTATTAAAAATCTACAATATCATAAAATCAGTAAAAGATAATTGA
AAATTAAGATGTTATTTGTTTAAAGATATTACTTAATTGTGTTTTGTTTTAAATTAATCAAATATTAGATACAACCTAATCTTTACAGATCAACAGTATC
TTAAAACACAGCC
GATATTGATGTACTTAAGCAACTCTTTGAAAATCTTTCCGATACAGACAAGCAACAGTTTCTAAGTGAAATTGCAAGCAGCAAAGCTACGATTCAAAAGG
TTATTCAACCAAGAGAAGTGAAAACCTGTCCACATTGCCAATCTACTCATTTTGTGAAAAATGGCAAAGCAAATAGCAATCAACGTTATTTATGTAAAGC
GTGCCGTAAAACTTTTGTAGAACAAACTGGTACTATATTATTTAGTATGAAAAAAGATATTTCCGTATTGGAAAAGTATGTTCATTGTATGATCGAAAAA
TACCCACTCCGAAAATGTGCGGAAATTTGCGACATCAACTTGGCAACCGCTTTTGCTTGGCGACATAAAATCTTAGATGCTCTGCAAAAAATGATGGAAC
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GCGAGGAACAGCGGCGACTAAACGTGGTTTATCTAAAGAACAGGTTTGTGTTCCAGTGGGTGTCAATCTGAATGGTTTATCTATTGCTAAGATAGCCAAT
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ATGGTTTTATGCGACTTGCCTTATGGCACAACTCAGAATAAGTGGGATAGTGTAATAGATCTCAATTTATTATGGGAAGAATATAATAGAATTGTCAAGC
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AAAAATCAAAATGCTACGTTATTTAAAGGTAAACTCATTGATTATATTGATTTGGCTTTAGATAGATTGAATAAAATCGGTGCAAGCGTAAGGGTTGTAA
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GGGGTTGTTATATCTAATTCTTGGTTAGCAAACGAATGGGGAGAGAAATTTAAGAAAAATTTATTAAAGCATTTTAAAGTATTAAAAGTAATCTGCTCAT
CAAAAGGAAAATGGTTTGGAAATGCGGATGTAGTAGCTACCTTACTAATTTTGGAGAAAACTACTCAATATACTGAATATGGAATAGATTTTATAACCAC
AAATACCTTAATTAAGGATTGGAATAAGCCTGTTTTAAAAGAAATGATTACAGCAACACTAAGCTCCAAAATACAATCCATACATTTGTCAAAGGCAACC
CATACAGTTAGAAATATAGACAAACTTCAGAAATTAGGGATTTCTTGGAATGCATTATTTAGTAATCTTGAATGAATTGATTTAGTTTCAGAAAAATTAA
AGAATGTTAGCAATTACATTAATGTGGCTCGTGGCGAACGCCGTGGGTGGGATAAGATGTTCTATCCTGAAAGTAAACATCAAATTGAATCTAGTTATAT
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GGCTGTACTAAATGCTTTTAATATCGAACTAGACCCTAAAACTATCTATGATAGTTTATTAAAAATCTACAATATCATAAAATCAGTAAAAGATAATTGA
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TTAAAACACAGCC
Protein section
ORF number : 4
ORF 1
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1023 bp | 340 aa | 86 | 1108 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MKITHDIDVLKQLFENLSDTDKQQFLSEIASSKATIQKVIQPREVKTCPHCQSTHFVKNGKANSNQRYLCKACRKTFVEQTGTILFSMKKDISVLEKYVH
CMIEKYPLRKCAEICDINLATAFAWRHKILDALQKMMEQVELDGVVQADETFTTISYKGNHKNFNLPRPPHKRGTAATKRGLSKEQVCVPVGVNLNGLSI
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CMIEKYPLRKCAEICDINLATAFAWRHKILDALQKMMEQVELDGVVQADETFTTISYKGNHKNFNLPRPPHKRGTAATKRGLSKEQVCVPVGVNLNGLSI
AKIANLGRPDVADLQKVLGGKVAQDSVFVTDSLCSYQKLSFDMGLNHIRIPRNKYKNGISNIQTVNNYHKRLKDLIFGTFKGVATKYLNNYIVYHNFVNF
AKDTKANKEVVLFDFIRNTFCQSRTVEIAKRPALPIWEIK
Blast result :ORF 2
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 801 bp | 266 aa | 1105 | 1905 | + | No |
Annotation : Cytosine methyltransferaseDescription :
ORF sequence :
MNKQISIQDMQNTLFEGDCLEIMRKFPDNSVDMVLCDLPYGTTQNKWDSVIDLNLLWEEYNRIVKPSGAIILTSQGIFTAKLILSNEKNFKYKIVWEKSK
PTNFLNAKKQPLRKYEDICVFYEKQPTYNPQMKQGEPYNKGVRKDQLTGSYGDFKPHLVKSDGGRCPTDVIYFKTAESEGKVLHPTQKPVELGRYLIKTY
TNENDLILDNTFGSGSFLVSAALENRYFCGIEKNQNATLFKGKLIDYIDLALDRLNKIGASVRVVR
PTNFLNAKKQPLRKYEDICVFYEKQPTYNPQMKQGEPYNKGVRKDQLTGSYGDFKPHLVKSDGGRCPTDVIYFKTAESEGKVLHPTQKPVELGRYLIKTY
TNENDLILDNTFGSGSFLVSAALENRYFCGIEKNQNATLFKGKLIDYIDLALDRLNKIGASVRVVR
Blast result :ORF 3
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 621 bp | 206 aa | 3155 | 3775 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MDVFELQTNSEISFVDPFVEKIVIKELPVMHAVVSNLPFVRFETAEIPNSMKLNNIELSKKSDLYVYIIFHLSNLIEENGRIGVVISNSWLANEWGEKFK
KNLLKHFKVLKVICSSKGKWFGNADVVATLLILEKTTQYTEYGIDFITTNTLIKDWNKPVLKEMITATLSSKIQSIHLSKATHTVRNIDKLQKLGISWNA
LFSNLE
KNLLKHFKVLKVICSSKGKWFGNADVVATLLILEKTTQYTEYGIDFITTNTLIKDWNKPVLKEMITATLSSKIQSIHLSKATHTVRNIDKLQKLGISWNA
LFSNLE
Blast result :ORF 4
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 234 bp | 77 aa | 4367 | 4600 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MILDPNLLSKEQVSEIVAKFQSILNSNVLDLPNELQQEDRIEFDRAVLNAFNIELDPKTIYDSLLKIYNIIKSVKDN
Blast result :
Comments
ISEisp1 is 84% aa similar to ISAur1.
References
1] ISfinder annotation (2017)
2] Bernier,A.-M. and Bernard,K. (2016) Direct GenBank submission.
2] Bernier,A.-M. and Bernard,K. (2016) Direct GenBank submission.