ISMvi1

  • Family IS1595
  • Group IS1595
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
LN554852 ND Moritella viscosa
Moritella viscosa MVIS1
DNA section
IS Length : 1018 bp

Ends


IR Length : 24/31

IRL : TCTGATTaccactaatgctcagccctcgtaaactatagttaagtgagtgt
IRR : tctgaTTACCACCGAACCTCAGCCAGCTTAAGTAGACGTTGAGGCATCGG

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
TTGCTTTGTACTAAAATTTTTATGTGTACCACTT8
TAAAAAAGATCATTATTTATTCTCGTGATGAA9

DNA sequence

TCTGATTACCACTAATGCTCAGCCCTCGTAAACTATAGTTAAGTGAGTGTGGTGATGAGGTTTAGGTCATGGCTAAAAATAAAGTACAGTTTCAAAAAGG
CATATCGATTCATCAATTTATTGAAAAGTACGGCACTGAAATACAGTGTCATAATAACTTATTCGATATGCGTTGGCCGATGGGTTATCGATGTCCTAAT
TGTGACAACAACAAGTACTGTAAACTAAAATCTAGAGCGCTGTATCAATGCAATAAGTGTCATTTTCAAACGTCATTGATATCTGGAACACTTTTCGCTC
ACTCTAAGTTGCCACTAACAACTTGGTTTCTTGCAATATATTTTGTAACGCAAGAAAAGAACGGTATCTCAGCGCTTGAATTATCAAGGTTACTTGGTAT
TTCGTATAACGCAACTTGGCGGTTAAAGCAGAAGCTAATGCAAGCGATGAAAGAACGAGATGATGAAATACCATTAGTTGATTATGTCCAGATAGACGAT
GCTTACTGGGGTGGCGTACGACGTGGTGTTAGAGGCCGTGGAGCCAAAGGAAAACGCCCCTTTATTGCAGCGGTATCAATCAATGATGAAGGGCATCCGA
TTGGTATGCGTTTTAGCGCTGTAGATGGATTCAACAAAGTAGAAATAACGCGTTGGGCTAAAGCCCACTTGACACCGAAGGCGATTGTTATTTCAGATGG
TCTAGCGTGCTTTCGTGCAGTTAAAGATGCCGAGATGCTACATCTTGCAGTTGTTACTGGCGGTGGTCCAGATAGTGTTGAGTGGCCTTACTTTAAATGG
GTTAATACAATGATAAGTAATGTTAAAAACTCAATGCACGGAACTTATCATGCTATTAACCAAAAGCATTTACCTCGATATTTGGCAGAGTTCTGCTTTA
AGTTTAATCGACGGTTTAATTTAAAAAATATGCTTGAGCAGTTAATCGTATCAAGTATTCGAACGGCACCGATGCCTCAACGTCTACTTAAGCTGGCTGA
GGTTCGGTGGTAATCAGA
Protein section
ORF number : 1

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
945 bp314 aa691013+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MAKNKVQFQKGISIHQFIEKYGTEIQCHNNLFDMRWPMGYRCPNCDNNKYCKLKSRALYQCNKCHFQTSLISGTLFAHSKLPLTTWFLAIYFVTQEKNGI
SALELSRLLGISYNATWRLKQKLMQAMKERDDEIPLVDYVQIDDAYWGGVRRGVRGRGAKGKRPFIAAVSINDEGHPIGMRFSAVDGFNKVEITRWAKAH
LTPKAIVISDGLACFRAVKDAEMLHLAVVTGGGPDSVEWPYFKWVNTMISNVKNSMHGTYHAINQKHLPRYLAEFCFKFNRRFNLKNMLEQLIVSSIRTA
PMPQRLLKLAEVRW

 

Blast result :
Comments
ISMvi1 is 85% aa similar to ISAwo1.
References