ISVesp1
- Family IS256
- Group IS1249
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
NZ_AENU01000007 | ND | Veillonella sp. | Veillonella sp. F0412 |
DNA section
IS Length : 1346 bp
Ends
IR Length : 27/28
IRL : GGGTTATAGGACAAAAAGTGTTGCTGTTAATGCCGATGGAACTAGTTAAA
IRR : GGGTTATAGGACAAAAAGTGTTGCTATTTTAGTCCCAAAGATTGGTAAAT
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
AAACGGATAT | AAAAATAA | CTATAACCAT | 8 |
DNA sequence
GGGTTATAGGACAAAAAGTGTTGCTGTTAATGCCGATGGAACTAGTTAAATACTAGCTCCATCGGCATTTTATCTTTTTGAGTGACTTTTACATATAGGA
CAAAAAGTGTTGCTAAAAAGTCTGAAACCCCTTGATTTTACTGACTCAAATAAGGTTTTATCTTTCTAAAGAGATATATTTTTTAGAAGGAGTATAATTA
TGAAACTAGTCAGATGCCCTAATTGTGGTTTCGTCTGTAAGAGAAATGGTAAAACAAATGCGGGTTCTCAACGTTGGTATTGTAATCAATGTTCTTGCTC
ATTCACAAATAAAGTGAATAAAACTAACAATAATTTACAGATATTTTTGGATTGGTTATTTGGTAAACATACACAGTTAGATATGGCTGGCGATGGACGT
TCATTTCGTAGAAAAACATCACAGTTTTGGGAGCTTTGGCCATTACCACCAAAAGTTGAATCATCAAGTAGTGTGGTATTTGTTGATGGTATTTATTTAG
CTAGAAATGCTTGTATTTTAATCTGTTGTAATGAGACGCATGTCTTAGGCTGGTATGTTTGTAGATATGAGCATTCTAAGGCTTGGGAGGCTTTATTACG
ACGTATTTCATCACCTATAGTAGTTATATCCGATGGTGGTACCGGCTTTCAAAAGGCATTAAAAAAAGTTTGGCCGAAAGCCAAACTACAAAGGTGCTTA
TTTCATGTATTTCAACAAGTAAAACGTTATACAACAATACGTCCTAAAACGATTGCTGGTTGTGAGTTATATGGAATTGCAAGGGATTTATTAACAATAC
ACACGCAAGATCATGCTATGAAGTGGGTACAAAACGTTATGTCATGGAAAGTACGACATAGGGTATTCCTATCAGAAATAACAGTTGATGAAAATGGTAC
GATACGACCTAAACATGAACGACTTATAAAAGCAGAAAATTCCTTAGTTAAATTGATTAACAAAAGATGTTTATTTACTTACTTAGATGCATCGTTAACA
TGTACCTGCCCAGCTACTAATAATCGTATAGAAGGTGGTGTAAATGCTCAGTTACGCACTATGTTACGTAATCATAGAGGAATGTCTATTGAAAGACGAA
TAAAAGCGGTGTTCTGGTGGTGCTATATGCACTCACCAAACCCGCTTTCTAATGCAGAAATACTTAAGGTTATGCCGACCAATAAGAGTATTTCTGATAT
ATATCATACCATACATGAACAATCTAGGTTAGAAGCTTCTATTCCGACTTGGGGTGATGCTATTGTTTGGAGTGATTTGCATAATTATGATCGCCTATTT
ACCAATCTTTGGGACTAAAATAGCAACACTTTTTGTCCTATAACCC
CAAAAAGTGTTGCTAAAAAGTCTGAAACCCCTTGATTTTACTGACTCAAATAAGGTTTTATCTTTCTAAAGAGATATATTTTTTAGAAGGAGTATAATTA
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ATATCATACCATACATGAACAATCTAGGTTAGAAGCTTCTATTCCGACTTGGGGTGATGCTATTGTTTGGAGTGATTTGCATAATTATGATCGCCTATTT
ACCAATCTTTGGGACTAAAATAGCAACACTTTTTGTCCTATAACCC
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1119 bp | 372 aa | 200 | 1318 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MKLVRCPNCGFVCKRNGKTNAGSQRWYCNQCSCSFTNKVNKTNNNLQIFLDWLFGKHTQLDMAGDGRSFRRKTSQFWELWPLPPKVESSSSVVFVDGIYL
ARNACILICCNETHVLGWYVCRYEHSKAWEALLRRISSPIVVISDGGTGFQKALKKVWPKAKLQRCLFHVFQQVKRYTTIRPKTIAGCELYGIARDLLTI
HTQDHAMKWVQNVMSWKVRHRVFLSEITVDENGTIRPKHERLIKAENSLVKLINKRCLFTYLDASLTCTCPATNNRIEGGVNAQLRTMLRNHRGMSIERR
IKAVFWWCYMHSPNPLSNAEILKVMPTNKSISDIYHTIHEQSRLEASIPTWGDAIVWSDLHNYDRLFTNLWD
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Blast result :
Comments
ISVesp1 is 52% aa similar to ISAar5.
References
1] ISfinder annotation (2013)
2] Durkin,A.S., Madupu,R., Torralba,M., Gillis,M., Methe,B., Sutton,G. and Nelson,K.E. (2010) Direct submission GenBank.
2] Durkin,A.S., Madupu,R., Torralba,M., Gillis,M., Methe,B., Sutton,G. and Nelson,K.E. (2010) Direct submission GenBank.