ISVesp1

  • Family IS256
  • Group IS1249
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
NZ_AENU01000007 ND Veillonella sp.
Veillonella sp. F0412
DNA section
IS Length : 1346 bp

Ends


IR Length : 27/28

IRL : GGGTTATAGGACAAAAAGTGTTGCTGTTAATGCCGATGGAACTAGTTAAA
IRR : GGGTTATAGGACAAAAAGTGTTGCTATTTTAGTCCCAAAGATTGGTAAAT

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
AAACGGATATAAAAATAACTATAACCAT8

DNA sequence

GGGTTATAGGACAAAAAGTGTTGCTGTTAATGCCGATGGAACTAGTTAAATACTAGCTCCATCGGCATTTTATCTTTTTGAGTGACTTTTACATATAGGA
CAAAAAGTGTTGCTAAAAAGTCTGAAACCCCTTGATTTTACTGACTCAAATAAGGTTTTATCTTTCTAAAGAGATATATTTTTTAGAAGGAGTATAATTA
TGAAACTAGTCAGATGCCCTAATTGTGGTTTCGTCTGTAAGAGAAATGGTAAAACAAATGCGGGTTCTCAACGTTGGTATTGTAATCAATGTTCTTGCTC
ATTCACAAATAAAGTGAATAAAACTAACAATAATTTACAGATATTTTTGGATTGGTTATTTGGTAAACATACACAGTTAGATATGGCTGGCGATGGACGT
TCATTTCGTAGAAAAACATCACAGTTTTGGGAGCTTTGGCCATTACCACCAAAAGTTGAATCATCAAGTAGTGTGGTATTTGTTGATGGTATTTATTTAG
CTAGAAATGCTTGTATTTTAATCTGTTGTAATGAGACGCATGTCTTAGGCTGGTATGTTTGTAGATATGAGCATTCTAAGGCTTGGGAGGCTTTATTACG
ACGTATTTCATCACCTATAGTAGTTATATCCGATGGTGGTACCGGCTTTCAAAAGGCATTAAAAAAAGTTTGGCCGAAAGCCAAACTACAAAGGTGCTTA
TTTCATGTATTTCAACAAGTAAAACGTTATACAACAATACGTCCTAAAACGATTGCTGGTTGTGAGTTATATGGAATTGCAAGGGATTTATTAACAATAC
ACACGCAAGATCATGCTATGAAGTGGGTACAAAACGTTATGTCATGGAAAGTACGACATAGGGTATTCCTATCAGAAATAACAGTTGATGAAAATGGTAC
GATACGACCTAAACATGAACGACTTATAAAAGCAGAAAATTCCTTAGTTAAATTGATTAACAAAAGATGTTTATTTACTTACTTAGATGCATCGTTAACA
TGTACCTGCCCAGCTACTAATAATCGTATAGAAGGTGGTGTAAATGCTCAGTTACGCACTATGTTACGTAATCATAGAGGAATGTCTATTGAAAGACGAA
TAAAAGCGGTGTTCTGGTGGTGCTATATGCACTCACCAAACCCGCTTTCTAATGCAGAAATACTTAAGGTTATGCCGACCAATAAGAGTATTTCTGATAT
ATATCATACCATACATGAACAATCTAGGTTAGAAGCTTCTATTCCGACTTGGGGTGATGCTATTGTTTGGAGTGATTTGCATAATTATGATCGCCTATTT
ACCAATCTTTGGGACTAAAATAGCAACACTTTTTGTCCTATAACCC
Protein section
ORF number : 1

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
1119 bp372 aa2001318+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MKLVRCPNCGFVCKRNGKTNAGSQRWYCNQCSCSFTNKVNKTNNNLQIFLDWLFGKHTQLDMAGDGRSFRRKTSQFWELWPLPPKVESSSSVVFVDGIYL
ARNACILICCNETHVLGWYVCRYEHSKAWEALLRRISSPIVVISDGGTGFQKALKKVWPKAKLQRCLFHVFQQVKRYTTIRPKTIAGCELYGIARDLLTI
HTQDHAMKWVQNVMSWKVRHRVFLSEITVDENGTIRPKHERLIKAENSLVKLINKRCLFTYLDASLTCTCPATNNRIEGGVNAQLRTMLRNHRGMSIERR
IKAVFWWCYMHSPNPLSNAEILKVMPTNKSISDIYHTIHEQSRLEASIPTWGDAIVWSDLHNYDRLFTNLWD

 

Blast result :
Comments
ISVesp1 is 52% aa similar to ISAar5.
References
1] ISfinder annotation (2013)
2] Durkin,A.S., Madupu,R., Torralba,M., Gillis,M., Methe,B., Sutton,G. and Nelson,K.E. (2010) Direct submission GenBank.