ISWosp9

  • Family IS4
  • Group IS231
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
ND Wolbachia sp.
Wolbachia sp.
DNA section
IS Length : 1437 bp

Ends


IR Length : 21

IRL : CATACGCGTCAAGTTAAGGAAAAGTGTAAGTAAAGTTGATAGAGTGAAGG
IRR : CATACGCGTCAAGTTAAGGAATGTAGAGAGCTTAAAGTAGATACCCTGGT

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length

DNA sequence

CATACGCGTCAAGTTAAGGAAAAGTGTAAGTAAAGTTGATAGAGTGAAGGAAAATAATAAGGTATAAATTCTCTTGGATATATGAATGAGAGAACTTACA
ATGGACAGAATAGCTTGCTTATCAAAAGACCTCAATGAATTCTTTAATGAAAAAGCAGACGAAATATCAATTGCAGTAGGTTTTATAAAAAGAAAGAGAA
AACTTAATGGCTCATCATTCATAAAAGCTATGGTTTTTGGTAACATAGGAGTTGATGATTGCAGCATAGAAACAATGTGCCAATTGCTAAATGAAGACTC
GATAGAAATTACAAAACAGGGTTTAGATTTTAGGTTTAGTGAAGAAGCAGTTGAGTTCATGAAAAAAATGTATAACGAAGCTTTGTGTTTATTTAAAAAA
AGTCTACAGATTGATTGCAAAATTTTACAGCAATTTGGAAGCGTTAAATTATTGGATAGCAGCTACACTAGCCTGCCCAGTAGCATGGAAGATATGTACA
AAGGATATGGCAGTAGCTATAGAGATTGTGAGAATAATACCAAATCAGGAATAAAGCTACAGTTAGTCTTTGATTACCTGAATCAAGCGCTAGATAAGTT
AAATTTTATGGAAGGAATAAGGTCGGATCAAGGTTATAGGGATTATCTGAACGGTTTATCAGCCAATGATTTGCTAATATTTGACTTGGGCTACTTTGTG
CCTAGTTCTTTTAAACAGATTGATGAAGCAGGTGCATATTTTGTTAGTCGTTATAAGTCTGATACCAATATATATGATATAGAAACAAATCAAAAAATAG
AGCTATTGGAGTATTTGGAAGGTCAATTATCTTCAGAAAAAGAAGTATTATTAGGAAAGGAAGTAAAAATTAAGGTAAGAATTATATGTCAAAAGCTAAC
TGAAGAACAGTCTATGGCTAGAAGAAGAAAGGCTAATAAATTAGCAAAGTCACATGGATATACATCTTCTCAAAAGAATCAAAAGTTATTAGATTGGTCA
ATATTTATAACTAATGTTCCAGAGAGTAAAATTAATGCTGAACAAATATTGACGGTTTATAGAGTAAGATGGCAAATCGAATTACTATTTAAACTATATA
AAAGTCATATCAATCTTGATAAACTAAAAGGAAAGACAAATCCATTTAGAGTATTGTGCGAGCTATACGCAAAATTATGTGCTATTCTCGTATTTCACGG
AATGATTGGCTGTGTAAAACTAAAAAAGAACACGGAGCTCAGTTTAACAAAGGCATTTATTGAATTGAAAAGGCGGGTTAGAGAGCTCTTTTTGATATTA
AACAATATTGTCAATAATTTAAAAATTTTTCTAAAAAAGCTTACTATAATCTGGTCAAAGTTTTCTTTGAAAGACAGATATAGGAAGACCAGGGTATCTA
CTTTAAGCTCTCTACATTCCTTAACTTGACGCGTATG
Protein section
ORF number : 1

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
1329 bp442 aa1011429+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MDRIACLSKDLNEFFNEKADEISIAVGFIKRKRKLNGSSFIKAMVFGNIGVDDCSIETMCQLLNEDSIEITKQGLDFRFSEEAVEFMKKMYNEALCLFKK
SLQIDCKILQQFGSVKLLDSSYTSLPSSMEDMYKGYGSSYRDCENNTKSGIKLQLVFDYLNQALDKLNFMEGIRSDQGYRDYLNGLSANDLLIFDLGYFV
PSSFKQIDEAGAYFVSRYKSDTNIYDIETNQKIELLEYLEGQLSSEKEVLLGKEVKIKVRIICQKLTEEQSMARRRKANKLAKSHGYTSSQKNQKLLDWS
IFITNVPESKINAEQILTVYRVRWQIELLFKLYKSHINLDKLKGKTNPFRVLCELYAKLCAILVFHGMIGCVKLKKNTELSLTKAFIELKRRVRELFLIL
NNIVNNLKIFLKKLTIIWSKFSLKDRYRKTRVSTLSSLHSLT

 

Blast result :
Comments
ISWosp9 is 90% aa similar to ISWosp5.
References
1] Mingxing Jiang (2012) Direct submission to ISfinder