ISWosp9
- Family IS4
- Group IS231
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
ND | Wolbachia sp. | Wolbachia sp. |
DNA section
IS Length : 1437 bp
Ends
IR Length : 21
IRL : CATACGCGTCAAGTTAAGGAAAAGTGTAAGTAAAGTTGATAGAGTGAAGG
IRR : CATACGCGTCAAGTTAAGGAATGTAGAGAGCTTAAAGTAGATACCCTGGT
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|
DNA sequence
CATACGCGTCAAGTTAAGGAAAAGTGTAAGTAAAGTTGATAGAGTGAAGGAAAATAATAAGGTATAAATTCTCTTGGATATATGAATGAGAGAACTTACA
ATGGACAGAATAGCTTGCTTATCAAAAGACCTCAATGAATTCTTTAATGAAAAAGCAGACGAAATATCAATTGCAGTAGGTTTTATAAAAAGAAAGAGAA
AACTTAATGGCTCATCATTCATAAAAGCTATGGTTTTTGGTAACATAGGAGTTGATGATTGCAGCATAGAAACAATGTGCCAATTGCTAAATGAAGACTC
GATAGAAATTACAAAACAGGGTTTAGATTTTAGGTTTAGTGAAGAAGCAGTTGAGTTCATGAAAAAAATGTATAACGAAGCTTTGTGTTTATTTAAAAAA
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CTTTAAGCTCTCTACATTCCTTAACTTGACGCGTATG
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CTTTAAGCTCTCTACATTCCTTAACTTGACGCGTATG
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1329 bp | 442 aa | 101 | 1429 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MDRIACLSKDLNEFFNEKADEISIAVGFIKRKRKLNGSSFIKAMVFGNIGVDDCSIETMCQLLNEDSIEITKQGLDFRFSEEAVEFMKKMYNEALCLFKK
SLQIDCKILQQFGSVKLLDSSYTSLPSSMEDMYKGYGSSYRDCENNTKSGIKLQLVFDYLNQALDKLNFMEGIRSDQGYRDYLNGLSANDLLIFDLGYFV
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Blast result :
Comments
ISWosp9 is 90% aa similar to ISWosp5.
References
1] Mingxing Jiang (2012) Direct submission to ISfinder