ISBwe1
- Family IS1595
- Group ISPna2
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
NC_010180 | ND | Bacillus weihenstephanensis | Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB401 |
DNA section
IS Length : 1536 bp
Ends
IR Length : 22/26
IRL : GGCTTTGTTAAAGGTAAATGTTGATATTTGAAACCTATCCGAAATCTTCG
IRR : GGCTCTGTTAATGTTGAATGTTGATAAAAAGTATTAAATATGGGAAGACA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
AGGGACCTTGTTTTAATTTT | AAAAATTAAAGAAACAAGACTTT | 0 |
DNA sequence
GGCTTTGTTAAAGGTAAATGTTGATATTTGAAACCTATCCGAAATCTTCGTATAATTGTATAAGAACAAACATTCGAGAGGTGTTAAGGTTGAGCAAAGC
GTTCAGTAATCTATTGAAACATATTGGCAATTTGTCACACACAGAGAAAGAGCAAGTGTTTCAATGGGTAAAACGCTATGTTGAACCTTCTTCCTCTGTC
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ATAATCGCCAACGCTATCGTTGTAAATGTTGTAGTAAGACATTCACTGATACAACGAATACTGTTCTTTACCGTACTCGAAAAGGAAACGAATGGATTAC
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TGGGCAGGGGCAAGAGTTAGGTTGTACAATGTTGGTATGAATAGAGAAGACAAAGAAAATGATTTCTACGAATACATTATTTCTTATATCTACGACAACG
ATAACTACTTACAACTAACTAATTTAACAACAGGAAAAGCAGGTTATATTATTTGTGTCATTGAAAAAGAATTGCCGAATAATTATGCTTTGGGTAAAAC
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TAATACTTTTTATCAACATTCAACATTAACAGAGCC
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ATAACTACTTACAACTAACTAATTTAACAACAGGAAAAGCAGGTTATATTATTTGTGTCATTGAAAAAGAATTGCCGAATAATTATGCTTTGGGTAAAAC
ATTAAAGCAAAGAATGGGCTTAGAAAATACCTATTTTAGATTTGAATATGAATAATCAACAACTAAGGGAAGCACCAACTCTAAGGTGTCTTCCCATATT
TAATACTTTTTATCAACATTCAACATTAACAGAGCC
Protein section
ORF number : 2
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1029 bp | 342 aa | 90 | 1118 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MSKAFSNLLKHIGNLSHTEKEQVFQWVKRYVEPSSSVGGRLINEMRETRFKEGFECPHCASEHVVRFGKHNNRQRYRCKCCSKTFTDTTNTVLYRTRKGN
EWITFVDCMFKGYSLRKSAEIVGVTWVTLFYWRHKLLSALKQLDFEKFEGIVEVDETYFLYSQKGQRGISERKPRRRGGKSKHRGISHEQVCVLVARDRT
KATVSKIACMGRVVKTKVDSMIGSKLTSDNVLVTDAWRAYKTYAKEKGIEHYRIKSNDGKHVIKGLYHIQNVNGLHSRMKQWIDRFKGVATKYLDNYLAW
FLFIDRKSNESTKHNIKEFLLTSFVFEMTDTYDSLRLSKFSV
EWITFVDCMFKGYSLRKSAEIVGVTWVTLFYWRHKLLSALKQLDFEKFEGIVEVDETYFLYSQKGQRGISERKPRRRGGKSKHRGISHEQVCVLVARDRT
KATVSKIACMGRVVKTKVDSMIGSKLTSDNVLVTDAWRAYKTYAKEKGIEHYRIKSNDGKHVIKGLYHIQNVNGLHSRMKQWIDRFKGVATKYLDNYLAW
FLFIDRKSNESTKHNIKEFLLTSFVFEMTDTYDSLRLSKFSV
Blast result :ORF 2
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
309 bp | 102 aa | 1147 | 1455 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MDNSKWISLSNVNDEEEIWAGARVRLYNVGMNREDKENDFYEYIISYIYDNDNYLQLTNLTTGKAGYIICVIEKELPNNYALGKTLKQRMGLENTYFRFE
YE
YE
Blast result :
Comments
ISBwe1 is 61% aa similar to ISBsp1.
References
1] Lapidus,A., Goltsman,E., Copeland,A., Lucas,S., Barry,K., Detter,J.C., Glavina del Rio,T., Hammon,N., Israni,S., Dalin,E.,Tice,H., Bruce,D., Pitluck,S., Richardson,P., Auger,S., Galleron,N., Sanchis,V., Gohar,M., Broussole,V., Brillard,J., Guinebretiere,M.-H., Ehrlich,S.D., Lereclus,D., Aymerich,S., Nguen-the,C. and Sorokin,A. (2006) Direct submission GenBank.