ISBse1
- Family IS1595
- Group ISPna2
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
NZ_ABHZ01000008 | ND | Bacillus selenitireducens | Bacillus selenitireducens MLS10 |
DNA section
IS Length : 1635 bp
Ends
IR Length : 24/29
IRL : GGCTCTGTTAAAGCTTGTTGTTGATATTTGCTTAAAACGAACAAATGTTC
IRR : GGCTCTGTTAAAGTTCAATGTTGGTATTTATATAAAAAACGACACTCCCA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
GGGTTGTATGGGGAATT | GTGAAGAA | AAAGAAAAGTCT | 8 |
DNA sequence
GGCTCTGTTAAAGCTTGTTGTTGATATTTGCTTAAAACGAACAAATGTTCTATAATGAAGTCATCAAACAAAAGCAGGTGACGACTGTGAGAACAACCGA
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CTGGAGGAAATCTCTGAACGGAAGCATAAGGACGGTTATCGTTGTCCTGATTGCGAGTCAGAGCATATTGTGCGGTTTGGTAATTACCCTATTATCGCGG
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GCAACATTTCAACTTCTATTTTTCGATATTAGAACGATGGGTAAAGAGAGGTAATATATAATACTTGTTCTTAAACAAGCGGGTTAGCGTTAGCAGAATA
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TTATATAAATACCAACATTGAACTTTAACAGAGCC
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1044 bp | 347 aa | 87 | 1130 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MRTTDILKTIQKLNPAEKHRLREYLIDALTASSSTGTVLEEISERKHKDGYRCPDCESEHIVRFGNYPIIADGEEVKKQRYRCKACRRTFTDLTNTALYR
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NYLAWFQVLESIHHQRNEVTMKDMIIKGNLIPNKETYDTLRLSKFTV
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Blast result :
Comments
ISBse1 is 71% aa similar to ISBwe1.
References
1] Copeland,A., Lucas,S., Lapidus,A., Barry,K., Glavina del Rio,T., Dalin,E., Tice,H., Bruce,D., Pitluck,S., Larimer,F., Land,M.L., Hauser,L. and Richardson,P. (2007) Direct submission GenBank.