ISLpl1
- Family IS30
- Group
Isoform Synonym(s) ISLp1
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
AF459445 | ND | Lactobacillus plantarum | Lactobacillus plantarum CCM 1904 plasmid pLp3 |
DNA section
IS Length : 1043 bp
Ends
IR Length : 22/24
IRL : GGTAGATTGTAAAATTAATCCGAACGCTGTTCGGACAAAAAAGATCAGCT
IRR : GGTAGATTGCAAATTTAATCCGAATTTTTGGACAAATTTGTCAGCATAAC
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|
DNA sequence
GGTAGATTGTAAAATTAATCCGAACGCTGTTCGGACAAAAAAGATCAGCTTCCTTTAAAATGGTGTTTACCACAAACCCATCTTTTAGGAGCTGATCTTT
TGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTC
AACAATTTCTTATGAATTATCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAG
CTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTT
ATAATTGGCTAAATCAGGAGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAA
TCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAATCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGG
CATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGCAAATCACGGTTCCTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCCC
TAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCATAGTTTTACGGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGG
TATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTTACGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGT
TTTGAGCACATTAGTGCTCAAGATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGC
TGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACC
TGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTC
AACAATTTCTTATGAATTATCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAG
CTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTT
ATAATTGGCTAAATCAGGAGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAA
TCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAATCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGG
CATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGCAAATCACGGTTCCTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCCC
TAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCATAGTTTTACGGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGG
TATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTTACGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGT
TTTGAGCACATTAGTGCTCAAGATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGC
TGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACC
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
930 bp | 309 aa | 100 | 1029 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELSRCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDELKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSI
YNWLNQERIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPMMINQRNRIGDFELDTVVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKDRTTATVNEA
LTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLESQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTRFEHISAQDLTTTLLQINQRPLKILDWQTPYQVM
LTNLSKNSD
YNWLNQERIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPMMINQRNRIGDFELDTVVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKDRTTATVNEA
LTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLESQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTRFEHISAQDLTTTLLQINQRPLKILDWQTPYQVM
LTNLSKNSD
Blast result :
Comments
ISLpl1 is 98% aa similar to ISPp1.
References
1] Nicoloff,H. and Bringel,F. (2003) Appl. Environ. Microbiol. 69 (10), 6032-6040