ISVlu1
- Family ISL3
- Group
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
CP081833 | Y | Vagococcus lutrae | Vagococcus lutrae Vagococcus lutrae BN31 Enterococcus faecalis EFs17-1 plasmid pEFs17-1 |
DNA section
IS Length : 1526 bp
Ends
IR Length : 21/29
IRL : GGCTCTATAATTTAAAGGACTGATGAATCAAATTTTGATTCATCAGTCCT
IRR : GGCTCTTTGTCAAATCGGACTGATGAGTCGGATATATAAGATGATAAACT
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
TCGCAGGGTGTA | AAAAAAAG | CCAACTACCGTC | 8 |
AGCTTAGGACTATTTTTTTG | AAACTCAAAAGGTCTTCAC | 0 | |
AGAGTAGAGGAGCAAAATTG | TTTTTTTGTGCAACAAAAAA | 0 |
DNA sequence
GGCTCTATAATTTAAAGGACTGATGAATCAAATTTTGATTCATCAGTCCTTTTTTAGTTTATTTAAATATAAAACATGTCGTCTATCTAGTAAAATTTAA
GTACGACCAAAAATCTAAGATAGAAAGGACGACATGTCTTGAATAATCATATCAAAAAAATGCTACGAATTACAGATGAACATTTAGATTTAACAAATAC
GGAGGAATATAAAATTAAAGGGAAGAACACTTTAGTTATCTTTGGAGTCTATTCTCCCATGCCTTCGGCTTGTAGGAACTGTGGTTCAACTATTGTTGAT
AATGAAGGGAAAAGTGTAGTTGTTAGAAATGGAAAAAAGGAAGTAACTATTCAGTTAGATTCTTATCAAAATATGCCCACTATTTTAAAACTGAAGAAAC
AACGATTCCATTGTAAAAGCTGTTCGCACAATTGGACGGCACAGTGTTCTATTGTTGAAAAAAACTGTCATATCAGTAAATTTATTACTTTGAAAATTTT
AGAATTATTAACTGAGAAAATCTCTATGACATTTATAGCTAAACAATGCCACGTTTCATTAACTACAGTTTTAAGAGTTCTTAAGTCAGTTGAATCACAA
CTCCCGCAACAACTTAAACCACGGAGTTTTCCAGAAGTTTTAATGGTAGATGAGTTTAGATCTCACGCTAGTTATGAAGATAAAATGAGCTTCATATGTG
CTGATGGAGAAACAGGTGAATTAGTAGATATTTTACCTAGTAGGAAATTAGATAAAATAACCCCTTACTTCAATCGCTCTCCGTTGGAGGAAAGGGAAAA
AGTTAAATTTTTAGTAACAGATATGAATGCTGCTTACTTTCAATTAACTAAAAATGTCTTTCCTACTGCTAAATTAATCATTGATAGGTTCCATATTGTG
AAGCATTTGAACACCGCTTTTAATGATTTTAGAGTCCGAGAAATGAAGAGATTAATTACCAATAAGAAAAAGTCAAAAGCAAATAAATTAAAATCAAACT
GGAAATTACTTCTAAAAAATCAAACAAATATTTCCATTTCAGAGTTCAAAACTTGGAGAAGTTTTCCTTCTCCAAAGTACCATCTTTTAACGGAATCTAT
GGTGATTGATCGACTACTCTCATTTTCTTCTGAACTAAAAGAAGCTTATGACATTTTCCATTTATTAATGTATCACTTTAGAAACAAAGATGACCGTTCC
TTTTTCGAACTATTGAAAAATCTACCTGATAGCTTGGATACACAATTTAGAGATAAAATAGAAAATCTGATTTCCTATGAAGAAGGTATTAGAAACGCTC
TTAAATATAATTTTTCCAATGGAAAAATTGAAGCTAAGAACACTCATATAAAAACACTTAAAAGAGTTTCCTACGGATTCAACTCATTTACAAATATGCG
TATAAGAATTTTCTTGATAAACGGCCTTATTAAAATTAAATAACTAAAAAAGATGATAAATCTGAGAGTAATCTCAAGTTTATCATCTTATATATCCGAC
TCATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCC
GTACGACCAAAAATCTAAGATAGAAAGGACGACATGTCTTGAATAATCATATCAAAAAAATGCTACGAATTACAGATGAACATTTAGATTTAACAAATAC
GGAGGAATATAAAATTAAAGGGAAGAACACTTTAGTTATCTTTGGAGTCTATTCTCCCATGCCTTCGGCTTGTAGGAACTGTGGTTCAACTATTGTTGAT
AATGAAGGGAAAAGTGTAGTTGTTAGAAATGGAAAAAAGGAAGTAACTATTCAGTTAGATTCTTATCAAAATATGCCCACTATTTTAAAACTGAAGAAAC
AACGATTCCATTGTAAAAGCTGTTCGCACAATTGGACGGCACAGTGTTCTATTGTTGAAAAAAACTGTCATATCAGTAAATTTATTACTTTGAAAATTTT
AGAATTATTAACTGAGAAAATCTCTATGACATTTATAGCTAAACAATGCCACGTTTCATTAACTACAGTTTTAAGAGTTCTTAAGTCAGTTGAATCACAA
CTCCCGCAACAACTTAAACCACGGAGTTTTCCAGAAGTTTTAATGGTAGATGAGTTTAGATCTCACGCTAGTTATGAAGATAAAATGAGCTTCATATGTG
CTGATGGAGAAACAGGTGAATTAGTAGATATTTTACCTAGTAGGAAATTAGATAAAATAACCCCTTACTTCAATCGCTCTCCGTTGGAGGAAAGGGAAAA
AGTTAAATTTTTAGTAACAGATATGAATGCTGCTTACTTTCAATTAACTAAAAATGTCTTTCCTACTGCTAAATTAATCATTGATAGGTTCCATATTGTG
AAGCATTTGAACACCGCTTTTAATGATTTTAGAGTCCGAGAAATGAAGAGATTAATTACCAATAAGAAAAAGTCAAAAGCAAATAAATTAAAATCAAACT
GGAAATTACTTCTAAAAAATCAAACAAATATTTCCATTTCAGAGTTCAAAACTTGGAGAAGTTTTCCTTCTCCAAAGTACCATCTTTTAACGGAATCTAT
GGTGATTGATCGACTACTCTCATTTTCTTCTGAACTAAAAGAAGCTTATGACATTTTCCATTTATTAATGTATCACTTTAGAAACAAAGATGACCGTTCC
TTTTTCGAACTATTGAAAAATCTACCTGATAGCTTGGATACACAATTTAGAGATAAAATAGAAAATCTGATTTCCTATGAAGAAGGTATTAGAAACGCTC
TTAAATATAATTTTTCCAATGGAAAAATTGAAGCTAAGAACACTCATATAAAAACACTTAAAAGAGTTTCCTACGGATTCAACTCATTTACAAATATGCG
TATAAGAATTTTCTTGATAAACGGCCTTATTAAAATTAAATAACTAAAAAAGATGATAAATCTGAGAGTAATCTCAAGTTTATCATCTTATATATCCGAC
TCATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCC
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1305 bp | 434 aa | 139 | 1443 | + | No |
Chemistry : Unknow
ORF sequence :
MNNHIKKMLRITDEHLDLTNTEEYKIKGKNTLVIFGVYSPMPSACRNCGSTIVDNEGKSVVVRNGKKEVTIQLDSYQNMPTILKLKKQRFHCKSCSHNWT
AQCSIVEKNCHISKFITLKILELLTEKISMTFIAKQCHVSLTTVLRVLKSVESQLPQQLKPRSFPEVLMVDEFRSHASYEDKMSFICADGETGELVDILP
SRKLDKITPYFNRSPLEEREKVKFLVTDMNAAYFQLTKNVFPTAKLIIDRFHIVKHLNTAFNDFRVREMKRLITNKKKSKANKLKSNWKLLLKNQTNISI
SEFKTWRSFPSPKYHLLTESMVIDRLLSFSSELKEAYDIFHLLMYHFRNKDDRSFFELLKNLPDSLDTQFRDKIENLISYEEGIRNALKYNFSNGKIEAK
NTHIKTLKRVSYGFNSFTNMRIRIFLINGLIKIK
AQCSIVEKNCHISKFITLKILELLTEKISMTFIAKQCHVSLTTVLRVLKSVESQLPQQLKPRSFPEVLMVDEFRSHASYEDKMSFICADGETGELVDILP
SRKLDKITPYFNRSPLEEREKVKFLVTDMNAAYFQLTKNVFPTAKLIIDRFHIVKHLNTAFNDFRVREMKRLITNKKKSKANKLKSNWKLLLKNQTNISI
SEFKTWRSFPSPKYHLLTESMVIDRLLSFSSELKEAYDIFHLLMYHFRNKDDRSFFELLKNLPDSLDTQFRDKIENLISYEEGIRNALKYNFSNGKIEAK
NTHIKTLKRVSYGFNSFTNMRIRIFLINGLIKIK
Blast result :
Comments
ISVlu1 is 76% aa similar to ISEfa5.
References
1] Zhu,Y., Zhang, W., Liu, S. (2021) Direct submission.
2] Zhu,Y. (2021) Direct GenBank submission.
2] Zhu,Y. (2021) Direct GenBank submission.