ISHahy10
- Family IS30
- Group
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
CP002304 | ND | Halanaerobium hydrogeniformans | Halanaerobium hydrogeniformans |
DNA section
IS Length : 1220 bp
Ends
IR Length : 21/26
IRL : GTTTCATTGTAAAATTAAATGCAACAGACAAAAAAATTAGAACCATAGCT
IRR : CTTAAATTGCAATATTAAATGCAACACCTATAGAAAAGACTAGTATAATA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
TTCACAAAAATTT | T/AAAATTT | TAAATTTTATTAA | 7 |
DNA sequence
GTTTCATTGTAAAATTAAATGCAACAGACAAAAAAATTAGAACCATAGCTAAAAACCTAGTATGATATAAGTGACCAAACAAAATCATATGGAGGTTTAA
GCTATGGCTCATACTAAAGATAATACCACAACTCAAAGAACTTTTAAACATCTTTCTTCTTATGAAAGAGGTAAAATTGCTGCTCTTCTGCAAGAAGGAT
ACTCTCAAAGAAAGATTGCTGAAAAGCTAGGCAGAAATCACAGCACTATTAATCGTGAAATTAAAAGAGGTACTACAACTCAACTTAACTATGATCTGTC
TACTTATGAACAGTATTTCCCTGAAACTGGTCAAGCTGTCTTTGAGAAAAATCGTTCTCACTGCGGTAATAAATCTAAATTGCTTAAAGTGGAATCTTTT
CTACAACATGCTGAAAAAATGATCTTGAAAAATGATTGGTCTCCAGATGTTGTTGTTGGACACGCTCTAAAAAATAATGAATTTACTAAAGATGAAATGG
TATCCACTAAAACTCTCTATAATTATATAGATCAAAATTTATTAGATGTTAAAAATATTGATCTTCAACTTAAAGTTCGCAGAAAACAAAGAGATCCTAA
TAAAAGAAAGCATAAAAGACTTCAGGGTAAAAGTATTGAAGAAAGACCAGAAACAGTTGATGATCGAAAAGAATTCGGCCACTGGGAAATTGATACCGTC
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AAAGGAGAACAAATAAGCAACTATACAGAAAAACAGATTCGGAGAATACAAAATTGGTGTAATAATTATCCAAGAAAATTATTGGATTATTCTACTCCAA
ATGAATTATTCCAAAAAGAACTTCAAGCTATTATTAACCCTGTTTAAACAATTTAAAATTCAAAATACTATATTATACTAGTCTTTTCTATAGGTGTTGC
ATTTAATATTGCAATTTAAG
GCTATGGCTCATACTAAAGATAATACCACAACTCAAAGAACTTTTAAACATCTTTCTTCTTATGAAAGAGGTAAAATTGCTGCTCTTCTGCAAGAAGGAT
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ATGAATTATTCCAAAAAGAACTTCAAGCTATTATTAACCCTGTTTAAACAATTTAAAATTCAAAATACTATATTATACTAGTCTTTTCTATAGGTGTTGC
ATTTAATATTGCAATTTAAG
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1044 bp | 347 aa | 104 | 1147 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MAHTKDNTTTQRTFKHLSSYERGKIAALLQEGYSQRKIAEKLGRNHSTINREIKRGTTTQLNYDLSTYEQYFPETGQAVFEKNRSHCGNKSKLLKVESFL
QHAEKMILKNDWSPDVVVGHALKNNEFTKDEMVSTKTLYNYIDQNLLDVKNIDLQLKVRRKQRDPNKRKHKRLQGKSIEERPETVDDRKEFGHWEIDTVR
GTRTKDNVLLTITERSTRQHLIRLLEDKSSAAVDQAIKKLKVQFSNVFKKVFKTITADNGTEFANLYNHDVDVYYAHPYSAWERGTNERHNGLIRRFIPK
GEQISNYTEKQIRRIQNWCNNYPRKLLDYSTPNELFQKELQAIINPV
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Blast result :
Comments
ISHahy10 is 73% aa similar to ISTki1.
References
1] Bassett K. (2017) Direct Submission.
2] Brown S.D., Begemann M.B., Mormile M.R., Wall J.D., Han C.S., Goodwin L.A., Pitluck S., Land M.L., Hauser L.J. and Elias D.A. (2011) J. Bacteriol. 193, 3682-3683
2] Brown S.D., Begemann M.B., Mormile M.R., Wall J.D., Han C.S., Goodwin L.A., Pitluck S., Land M.L., Hauser L.J. and Elias D.A. (2011) J. Bacteriol. 193, 3682-3683