TnBth3
- Family Tn3
- Group
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
CP003766 | ND | Bacillus thuringiensis | Bacillus thuringiensis HD-789 pBTHD789-3 |
DNA section
IS Length : 7428 bp
Ends
IR Length : 59
IRL : GGCCTCACCATACCATTTCGGGAAAATTGTACGTTTAGACACAATTTAGA
IRR : GGCCTCACCATACCATTTCGGGAAAATTGTACGTTTAGACACAATTTAGA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
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DNA sequence
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CTACATGAAGAATGGAAGTACTCTATAGTTTCCAATGTACTTTATATTGCATTCTCTTTTAGCAAAAAAGGTACATATCGTTCTAATTAACATACAAACT
TTAAAATTTTTCAACAGAATTTATTATCTTTTTTACTTGTTTGTATATATCTCCTCCATATTTTGTAGCATTAATGCAAGTAACTTGTGGAAGTTTAGAA
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GAAGGAGCTTCCAATGTATAGTTATGGATTTTATATTCCTGTTTTTCTATAATTGGTCCTTCCCATTTAAAGTCAATCTCAAAAAATTTCTTTTTATTTG
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TACAACAATTTCAGATCCTTCTGTGCGAACCGTTTTTCTAGTGACAAACATATTATCCCCTACATTTTCTGGAATAATCCCATGTAAGGCATCTGTTCCT
AATGATGCAAACCAAATATTTGTAGTTGATTTATCTTTTATACAATGTGTTGGTTGAAAATCATTGATATAAATCTTCCAGCCATCAAAAGAAGATTTTC
CATCTATTACTGGTGGAATTTGATCTCTATTATAATAAGCTTTTCTAATCTGTTCATAACCTGATTGATTGGTGAAAATAACGCCAGATTCGCCTTCTTT
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TATTATCGTGTCCATAAACAGTGTACAATTATGTATGTTCAGATATCTATCTAAAATTAAATTATTGAACAGGGAGAGACTATAAATTGAAAATTGGTTA
TGTTCGTGTATCAACTGTAGATCAAAATTTGGATTTACAAATAGATGCTTTAAAGGCGTATGGATGTGATGAAATATTTGAAGATAAGTTGAGTGGCATC
GCCGGAAAAAGGCCCGGCCTTGAAAAAGCTCTTCAATATGTGAGACCTGGTGATTCTCTTGTAGTCTGGCGACTTGATCGTTTGGGAAGAACGATGCATC
ATCTTATCCAAATTGTAAATGAATTAAATGAACAGGGTGTTAGTTTCTATAGTGTACAAGAAAATATCACGATGGATCGCTCTAGCGCTACAGGACAATT
GATGTTTCACTTATTTGCTTCTTTTGCAGAATTTGAAAGAAACCTCATTCGTGAACGGACAGAAGCGGGAAGAATTGCTGCAAGGGCTCGGGGACGTTTT
GGTGGAAGACCTGAAAAGTTAGGAGAAAAAGAACAACAAATGATACAAACACTCGTGTCTAAGAAAACCCCAATCAAAGATATTGCGCAAATATTAAAAA
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ATTATCAGACCAGGTGAGTGAACGAGAGCGGATACGATACTATACATTATCTGAAGAAGATATACAAATCATCCGTCAACAACGTGGAGCAACGAATCAA
TTAGGTTTTGCGTTTCAACTGGCGTATTTACGATTCCCTGGGCGCCCATTCGCTTCTGGAGAAAAAATACCCGATTTCCTTGTATCATTGCTTGCAAAAA
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TTCTTTTACCTTACGAGAATATCGAGAATTAGCAAATTGGCTTCTTCCAACTGCTATGGGAACCGAGAAAGGTCTAGTCTTAGTTGATCTTTTGATACAA
GAAATGCGAAAAAGAAAAATCATTCTTCCTGCCATGTATGCCGTAGAACATTTAGTTTGGGCGGTATGTGAACGTGCAGAAAGGCGAACGTTTAAAAAAT
TAACAAAAGCGTTATCTCCACAACAACTTTTACAATTAGACCAGCTATTAACAAAGTCTGCAGATAAACATATTACGAATTTATCCTGGTTACGAAAACC
ACCTGGGACGGTTTCTCTTAAAAATTTTCATAAAATATTAGATCGCGTTCAATTTATTCAAAGGCTCGCATTACCATTAGAAAACGGACAAGAGATTCAC
CAAAATAGATTACTACAATTAGCTAGGGAAGGCTCTCGATATTCCACCCAACATTTGTCTCGATTCCATTCCATGAAACGGTATGCAACTTTAATGGCAT
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TTTGTATCTTTACAAGCTGTTATACCATGGGACCAATTTGTTTATTCGGTAGAACAAGCGGAAGCGTTGGCGAGGCCTGCAGAATTCGATTATTTAGAAT
TACTGGATACCTATTATGGACAATTTCGCAAGTTTGCCCCCCGACTTTTACAGATTTATACGTTTCAATCTTCTGGTATCACCCAAACATTATGTGAAGC
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AATACAAAAACTTTGATGAGTACTTATTACCAGTACAAACCTGGGAAGAAATCAAAAGAAAACAACAAATTCCATTGTCTATTGCTACAAATGTAGATGA
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CACATCCAAATTCCATCTTTAAAAAAGGATGTTCCAGACGATGTGGCGGATATTACAAGGGCTATTTATGATGTATTACCACGTATTAAATTAACAGAAC
TATTAGTAGAAGTAGACTCTTGGACCCGTTTTAGTCAACAGTTTGTACATCTTCATACAAAAACAGGGCCAAAAGATGAAACTGCATTATTTGCGGCGAT
TTTAGCCGAGGGGATTAATCTTGGATTAAGTAAAATGGCTGATGCATGTCCTACTGTTACCTATACACAACTTGCTTGGATAGTAGATTGGTATATCAGT
GATGAAAATTATACAAAAGCTCTGGGAGTCTTATCAAATTTTCAACGGCAAAATAGGCATGCTGCCCATTGGGGCAATGGAACCACTTCTTCTTCAGATG
GACAATATTTTAGGTCAAGTGGTGCTTCTAGTCCATTAGCTCAAGTGAATGCCAAACATGGAAGAGATCCTGGCCTAAACTTCTATACTCATATTTCAGA
CCAATACGATCCTTTTTATGCTCAAGTCATTAGTTCTTCTGAGGAAGCGCCTCATATTATAGACGGATTATTATACCATGAAGCCGATACTAGAATTGAA
GAACATTATACGGATGCTGCTGGATTTGTAGATCATGTATTTGCTATGTGTCATATGTTAGGGTTTCGATTCTCTCCGAGAATTAAAAGTATAGATAAGA
CGAAAATTTATACAATCGACAAGCCTACCTATTATCCAGAGCTAAACTTTATGATTGGCGGCACCATACAAATGAAACATATACGAGACAACTGGGATGC
ATTATTGAGATTAATCAGTTCTGTGCAAAATGGAACGGTTACTGCATCGCTTATTTTAAAAAAGTTAGCATCTTATCCACGGCAAAATAGTTTAGCGGTA
GCATTACGAGAAATTGGACGTATAGAAAGAACATTATATACATTAGAATGGCTGCAAGACCCTGCACTGAGAAGGCGAGTTCAAGTCGGACTCAATAAAG
GAGAAGCGAAACATTCGCTTGCACGAGCCGTGTGTTTTCATCGATTAGGAGAAATACGTGATCGTTCTTATGAAGATCAATTGCATCGAGTGAATGGTCT
GCAGTTATTAATTTCTGTAATTGTCATTTGGAATACAGTGTATATCGAAAAGGCGATTGAATTATTACGATCTCAAGGAATGGAAATTCCAGAAGAATAT
GTGCAACACATTTCTCCATTAGGTTGGGAACATATTGCATTAACAGGTGATTATATCTGGAATGTACAGAAAAAAACATCGATTCATCATTTAAGACCTT
TGCGAACAAAATATGTAAGAAATAGATACTAACACCCATTACCGATTCCCTATGTAAATACGGAATCGGTAAAATGTGTCTAAATTGTGTCTAAACGTAC
AATTTTCCCGAAATGGTATGGTGAGGCC
CTACATGAAGAATGGAAGTACTCTATAGTTTCCAATGTACTTTATATTGCATTCTCTTTTAGCAAAAAAGGTACATATCGTTCTAATTAACATACAAACT
TTAAAATTTTTCAACAGAATTTATTATCTTTTTTACTTGTTTGTATATATCTCCTCCATATTTTGTAGCATTAATGCAAGTAACTTGTGGAAGTTTAGAA
GAAACTTCTTTTAGTTCTAAAATATCATTATCAATGAATACAATTTTTTGTAATTTAATATGAAACAACCTAGCAATCTTTTTAATTGAAGTTGATTTGT
TGTTAGAACTTAATTGTGGTAATACGAAGTATTTTTCTATTCCAAGTTGCTTTAGCTTGGCTAATCCCTTAGTATAGTCAGTTTTACTAGCAATAGACTG
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TCTAAATCCCATACTACACATTGAATGTTTTTTTGGTTTTTAATAAATTAATTGTTGTATGTATGTCATCTGAATAATTTAAATCGATTTCATCTGCTAA
TTCTTTTAAATCATGATGAAGGATATGACGTTTTTCATCATCTGTTCCCTCACTAAAATCATGCACATCATTTGTAACAAAATATATTTGATCGTAATCA
CATTGATTGTTATTGTTAAATTTATTTGAGAAATGTTCATACATACTAAAGAAAATCACAGCATCCCCCATACTGTTTTTGTGTCCAAAGGGTTTCTTTT
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ACTTTATACTTTTCTTTTGAAAAAGCCTCATCAAAATTTTTCTCCAATTCAGTTTCTAATCTCACATATTCATGAGGTAATATGGGGGATTCTAAAGATA
AATCTAAATCTACAGAAACTCTATTATGAACATTATAAACTAAGTTCAAAACACTTCCCCCAGTTAATACCGTTTTATCTACAAAAATATCACTAGATAA
AAGGGCACATAAAGACAAGTTTTGAAAGTGTTGAATCTGTTTTTGTATGTTTATTTTATTTTTAACGCGGGATTTTGGGTGTTGTTCATCCTTATCTATT
TGATTGAGCCCATGTGTATAAATAAACATCGGAGATTTTTGATTGTTCATTTTTAGACTCCTACTATAAATTTTTTAATGCATCAATCAGGTGTTAAAAA
TTTATCTTTTATACAAAGGACTCTATTATATTGCTACATTTTTCACACTAGCAAGTGCCGCTTGAGATCCTAACGCAAGTCCCACTGGCCATGTTTTGTG
TACAACAATTTCAGATCCTTCTGTGCGAACCGTTTTTCTAGTGACAAACATATTATCCCCTACATTTTCTGGAATAATCCCATGTAAGGCATCTGTTCCT
AATGATGCAAACCAAATATTTGTAGTTGATTTATCTTTTATACAATGTGTTGGTTGAAAATCATTGATATAAATCTTCCAGCCATCAAAAGAAGATTTTC
CATCTATTACTGGTGGAATTTGATCTCTATTATAATAAGCTTTTCTAATCTGTTCATAACCTGATTGATTGGTGAAAATAACGCCAGATTCGCCTTCTTT
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TGCGAACAAAATATGTAAGAAATAGATACTAACACCCATTACCGATTCCCTATGTAAATACGGAATCGGTAAAATGTGTCTAAATTGTGTCTAAACGTAC
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Protein section
ORF number : 6
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
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Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MQTIQSLHNLGIIQSIASKTDYTKGLAKLKQLGIEKYFVLPQLSSNNKSTSIKKIARLFHIKLQKIVFIDNDILELKEVSSKLPQVTCINATKYGGDIYK
QVKKIINSVEKF
QVKKIINSVEKF
Blast result :ORF 2
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
753 bp | 250 aa | 1366 | 614 | - | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MYFKKENEMKYIWDKPTAFILDTNIWLNFLNGSEQGVQTFRKMEELIAANKIILFAPEQVLLEWNRHYTSILQQKLTTTKETLDQAKSFIKYFYEPTDNS
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VHDFSEGTDDEKRHILHHDLKELADEIDLNYSDDIHTTINLLKTKKTFNV
Blast result :ORF 3
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
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Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
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ELEKNFDEAFSKEKYKVLNSRLEIRSLNLHNKFSSENLFDPKEILYKYTFQLMDLHEYEEICNHPGSTKEQKEARCKDSIIMLPNKKKFFEIDFKWEGPI
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HQSNFTDSVRNMSLFPLKSFEYYFDCIIHLIDYMYPFLTTLKSVQSPHS
Blast result :ORF 4
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Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MALNAQAQFLSILELTKGLLENSPKRLQHLEVFPFHHVEGDSLRYVRTPELTPASIIGFGDPIPDNTTIPDEPITFPMSELATSFLVAYKGQDIYSYTND
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Blast result :ORF 5
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2982 bp | 993 aa | 4351 | 7332 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MATREVLTQTQREYFYKLSDQVSERERIRYYTLSEEDIQIIRQQRGATNQLGFAFQLAYLRFPGRPFASGEKIPDFLVSLLAKRLGIVPAAIHNYAKIRD
TTRREHISKIRKHFGFRSFTLREYRELANWLLPTAMGTEKGLVLVDLLIQEMRKRKIILPAMYAVEHLVWAVCERAERRTFKKLTKALSPQQLLQLDQLL
TKSADKHITNLSWLRKPPGTVSLKNFHKILDRVQFIQRLALPLENGQEIHQNRLLQLAREGSRYSTQHLSRFHSMKRYATLMAFLIHIYAFLIDQGLYVN
EKLLGRMFKRGEKIHNDSFQNDGKLINEKIRLFAKLGKVLIEAKEREQDPFVSLQAVIPWDQFVYSVEQAEALARPAEFDYLELLDTYYGQFRKFAPRLL
QIYTFQSSGITQTLCEALEILKELNTSKKRKVPEFAPMDFIKSKWLKHVLKEDGIDRHYYEFSVWTELCNHLRSGDIWVPGSKQYKNFDEYLLPVQTWEE
IKRKQQIPLSIATNVDEYLQNRCGLMQEQLTMVNQLIRNQELSDVSVYGGHIQIPSLKKDVPDDVADITRAIYDVLPRIKLTELLVEVDSWTRFSQQFVH
LHTKTGPKDETALFAAILAEGINLGLSKMADACPTVTYTQLAWIVDWYISDENYTKALGVLSNFQRQNRHAAHWGNGTTSSSDGQYFRSSGASSPLAQVN
AKHGRDPGLNFYTHISDQYDPFYAQVISSSEEAPHIIDGLLYHEADTRIEEHYTDAAGFVDHVFAMCHMLGFRFSPRIKSIDKTKIYTIDKPTYYPELNF
MIGGTIQMKHIRDNWDALLRLISSVQNGTVTASLILKKLASYPRQNSLAVALREIGRIERTLYTLEWLQDPALRRRVQVGLNKGEAKHSLARAVCFHRLG
EIRDRSYEDQLHRVNGLQLLISVIVIWNTVYIEKAIELLRSQGMEIPEEYVQHISPLGWEHIALTGDYIWNVQKKTSIHHLRPLRTKYVRNRY
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Blast result :
Comments
TnBth3 is 66% aa similar to TnAcsp1.
References
1] ISfinder annotation (2017)
2] Doggett,N.A., Stubben,C.J., Chertkov,O., Bruce,D.C., Detter,J.C., Johnson,S.L. and Han,C.S. (2013) Genome Announc 1 (6), e01023-13.
2] Doggett,N.A., Stubben,C.J., Chertkov,O., Bruce,D.C., Detter,J.C., Johnson,S.L. and Han,C.S. (2013) Genome Announc 1 (6), e01023-13.