TnBth2
- Family Tn3
- Group
Isoform Synonym(s)
| Accession number | Transposition | Origin | Host |
|---|---|---|---|
| LXLI01000054 | ND | Bacillus thuringiensis | Bacillus thuringiensis GOE4 |
DNA section
IS Length : 9127 bp
Ends
IR Length : 39/43
IRL : GGGGCACGACAACGATTCCTTCTTTTTGGGGCCACTCAAAAAACAGATAG
IRR : GGGGCACGGCAACGATTACTTCTTTTTGGGGCCACTTAATAAAATAGCCA
Insertion site
| Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
|---|---|---|---|
| ATTTTGAGCCCACTC | CACCA | TATTGTTTCATCCCC | 5 |
DNA sequence
GGGGCACGACAACGATTCCTTCTTTTTGGGGCCACTCAAAAAACAGATAGAATTCAAAAAATTTATTGAATCCCATCTGTTTCTAATCGTTGTTAATATA
TATATAAATTCGAAAGATTTTCTTCTAACAAGCTTGCATTATAATTAGGGGCTAGTACAATGTTTGTGTATGTTCCTACACCTGAAAGGTACTTGTATTT
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TTATGGAATGGTTACAAATTTCACATGAACGAAATTGGAATCCTGATGAAATAAGTGCAAAAGTTATTCATGAATGGATTCATCATATGCAGACCATTGA
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AAAAATTGGTAGTGTAGGAACTATTACAATTCGTGAAGGTAAAGGTGGTAAGCTTGATGTAGTAAAAGCAGTAAAAGATATTTGTCGCGCCCTCGATGAG
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ATCACCATGATTCGGAACTATCGAAAAGCAAAAACATTTGATAATCAAGCCCGTCAAATTATGTTAACAGCAATGGAAAACGCAGTGTTAGAGAAAGATG
CGAAAAGTGATATTGTGAATATTGCGATTGACGAATTGGTCAAACATAGTTATGAATTACCTGCATTTCAGACGTTAGTAAAATCTGTAGACCATATCCA
TAGTATGGCTTATCGTACTTTATATAAACGAGTTGCAGATTCATTAAGCAATGAAGAAAAAGAAAAAATAGATACACTATTTCAACAGATTGATGGAGCT
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ACTTGAACAACATAAACGATACACATTAGCTATAGCTTTATTACATGTTCAATACGCCAAAACGATTGATGATATTGGAACAATGTATATCAAACGAGTT
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CTACTTATCAACTAGAAGGTTCTTCTGAAACACGATTACAATTATTAGAAACACTAATTGGTGGAAATCGTGGGCAACAAATTCTAGAGAACTGTGAAGA
ACATTTAGCCTATACTGGAAATAACTATTATTCTTTTATGTGGAGATATTTAAAAAGTAATCGTTCTGAATTAATTAAGATGTTGGAGTCATTAAAGTTT
AAATCAACTACACAAAATAAAGGACTAGAACAAGCTATTTCTTTCCTATTAAAAAATAAACATAAAAAATCTGAATGGATTTCAACTATCTACACGCGTA
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AAATGTATATCCAAACAAAATTAATAGACGACACTTTGAAGCTTGTGTATTTTATCAAGTTAGAAATGAATTAAAATCCGGAGATTTATGTATTGAAGGT
AGCGAACAATACGCTGATTATCGAGAGCAATTAATATCTTGGGATAAATATCGCCAAAACTTACATACGTTTTGTGAACAAGCAGGCCTTCCAACAACAG
CTGGAGAATTTAAAAAACAGGTGTATGATAAGCTTGAAGAACTTGCGAAAAAAGTAGATACTTCTTTTCCAAAAAATAAAGCTGTTACCATTCGAAATGG
AGAACCTTTTATAACAAAATTAAAAAAGAAAAAAATATCACCGTTATTAAAGGCCGTTAGAAAACGAATTGAAGAGAAAATGGTACCTATTAATGTTTTA
GATTTATTGAGTGACACAGAGTATTGGTTAAATTGGACAAGATTTTTTGGTCCTATTTCTGGTTATGATGCCAAAATCGCTAAACCATCTCAACGGTATC
TAACAACCGCTTTTTGTTATGGTTGCAATTTAGGTCCTACTCAAGCAGCCCGTTCCCTCGGTACAGTGGATCGAAGGCAAATTTCTTGGATTAATGAACG
ACACGTTACTGAAGACAATATCCAGAAAGCCATTGAATGGTTAATTAATGCTTATAATAAATTTAATCTACCAAAATATTGGGGAACTGGAAATAGTGCG
TCAGCTGATGGAACAAAGTGGGATCTCTATGAACAAAATTTATTATCTGAAAATCATATTCGTTACGGTGGGTATGGTGGAATTGGATATTACCATGTTT
CAGATAATTATATCGCCTTATTCAGTCACTTTATACCTTGTGGTGTCTGGGAAGGTGTTTATATTTTGGATATTCTAATGAAAAATCAATCTGATATTCA
ACCCAATACACTGCATTCTGATACGCAAGGACAAAATGCACCGATATTTGGATTATCCTATTTATTAGGAATCCAACTTATGCCCCGGATTCGAAATTGG
AAAAATTTAAAATTATTAAGGCCACATAACGACTCTAATTATCAGCATATTAATGAACTATTTACAACTTCGGTAAATTGGAACATAATTGAAGATCATT
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AATACAATCATCTAATTGCAAATTGTGTCATTTTTTATAACGTCTTTCAACTTACTCGTATCCTGCATGAATACATCCAAGAAGGAAATGAATTAGACGA
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GATATGGCCATTTCACCTAATGGATTAAAAGCTGCAAATTAAACAAAAATAGCCACAATCTATTTATAAATAGATTGTGGCTATTTTATTAAGTGGCCCC
AAAAAGAAGTAATCGTTGCCGTGCCCC
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ATGTTTGAAACCGGATGGAATAAAAACAGATGCGGGGCTCTCAATGATTTGTACGTCTCCTTCAATTTCCACTTCACATATAAGCCCTGTACCATCTATG
TTATTACCCCAAAATACAAAAGCACTATCACAATGATGTTCATGAGAATCCACATGACCTTCCAAATTTCCGTCCATATGCTCATTACAGAATATACGTT
GTATTACATAAAATGAAGCGCGCTCATCTGTTCTATAATCCATTTGTACCCATCTTTCTCCTGGCCCATCCCTATGATACAACAGTTCGGACGCCCCTTT
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TGTAAATCTGATTTTCATTCCTAAAGTGTTAGCTTCTTCAATCGCTTGCTTCACTTGGTTTACCACATAATCTTTTGATCGATTGGTATACTTTGTTTGT
AAAGAAATTGGATTAATAGACGCCCAAATTCCGACCCAATCGGCACCAGCTCGATAAGCAGCATGAACTTCTTCTTTTTTTGCTCGAGCATGCATTAAAA
TATCAGCTTGTTTTGCAGCCGCCGCGACTTCTCGGCAAACCTTTTCTTCTTCATCAGAAATTCCAGGATGTCCAACTTCAATTAACTGGATTCCAAAATC
CTCAAGCATATGAAGCAGTGTAATTTTATCTTCCTTCGAAAAACGAACACCACATTGCTGTTCACCTTCTCGCAAAGTAGCATCTAATATTGTTATATCT
TTGTTCATCCCTTTTTTCCTTCTTTCATTTCTATAAAATTCAACACTTCTTTAAATAGAATATCATGATTTTTTTCATATACTGCCCAGTGTGTTGCATC
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GAATAGTTGGGCACATCAAAAGCTGCTGCAGTAGGAACACTAAATGGTTCCAAAAACAAAATAATTTCATCTGATGTATATTGTTTTTGTGTATTTACAC
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GGCTATAATTCCAGCTGCAATAATTAATCCCGCTGGTAACCCCTTTGTAAACAATACAGCCATCAGAGTACCTATTAAAACACCTAATAATATAGTAGGG
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AATAGTTTTTTGTCCCATAGCAAAAAACACGCCTAATAAACTTGCTGCAATAGCTAATGCATAATCTTTCACAACCAATGCGAGTATAAAAATAGTTCCT
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GATTAATATCTTTTAAGGTTTCTAGAGCCACAAGTGCCTTTGGCTTCCCTAACTTACTTATAGAACTGAGCATCTGTCGATTAATATTACTCGCTTCGAA
AACATCTTGATCAATTACATGAAGCTTCCCTATTCCCATTCGTGCCAACTGAATAAGCGTAATCCCTCCTACTCCTCCAGCACCAACTACAGTAACGCGA
GCATTTTTTAATTTTTCCTGTTCTTCTATAGAAATGACACCAATATTTCTTGTAAAGCTTTCTTCATATATATTTTGTGTATTTAAATTTCTAGTGAACA
AATCTGATTCCCCCTTATAATGTTCCATAATCCCAACCATTTTCTGGTGCGTCTTTTATCTGGACAGGAGTGAGACTATCTACATCTATAACAATCCCCT
TTGGTGCTCTAGCCAAAGGTTCACGCCCCGTTAACACTTGTATTGCTTCATGAAAGCTAAATAATGATAAAAGATGTGCTCGCATAGGTGTAATAATCCA
GCCTACTTTTCCCTCACAAAAATCTTTTGCCCACTCTTCAGGTGCTCCCTTATTAACCGAATACCATGCTCTTTTTTTCTTAATATCAGCAATTTGCTGC
CTTAACTTTGAATCTGTTAATTTGGATCCTACAACAGACACATTCAACGCCTCTTCATATGGAATCCCATTTGGAAAGAATGTAGAAACGAAACCTCTTG
TAGGGGGACTCCCTGACATACCTACACTTGGTATCCCTAATTCTCTAGCTGTTCTATGTATAATGACCCTAGAAGGCATATCATCCACAGCTTCTATCAC
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TCAGCAACTGTTGCTTTAGGTTTTCCTACTACGCTAGAAAGCGCTAACATTTGTCTGTTTATATTAGATATTTCAAATTCATCTGGATCGATCCCTGTAA
TATGCCCAACCCCCATTCTAGCAAAAAGAATGGCTTCATAACCTCCTACCCCCCCTAATCCAAAGATAATTACTCTTTTATTCCTAAGACATTCTTGCTC
TGCTCTTGAATAGACACCAATATTCTTTTTTACCATTTCCCAATAGTAAGTATCCATTGAAAAACCTCCTATGATGTAATCATTATAAAAAAGACTATCT
ATATAAAATAATCAATATGTATAACAATAATTTAAAAATATGTTACTTTTGTGAGTTATTTGTAAAAAAAATTAAAATTTTCAAGTTATTTATCTTTTGT
TAACAGAATATGTATTCCGTTAACTTATTAAACTTAATATAATAGATATTGTTTACGGAACACATTTAAAATCGATGATAAATTAAGTTTACGGAACACA
ATTGAAGAAAGAAGGATAACAATGGATTTTAAAACCTGGTTAAAAAATGAGGGGAAACGAGAGCAGACCATTCAAGTATATGTTCGTTCAGTCCGTCAAT
TTATGGAATGGTTACAAATTTCACATGAACGAAATTGGAATCCTGATGAAATAAGTGCAAAAGTTATTCATGAATGGATTCATCATATGCAGACCATTGA
AAAAGTGGCAAAACCTACAATAAATAAAAGAATTGCCTCATTAAAAGTATACTGGTCGTATCTTATTGAACAAAGGATTGCAATATATGATCCCACAAAA
AAAATAAAGATAAAACGTATTTCTAGATTAGAAGACACTCCACGTTGGTTGAATGACATGGAACAAGTTAAATTACTTAACTTGATTCGACGAGAAGAAA
ATGAATGGAAACGAAAAAGAAATATGGCCATGGTTCGTTTAATGTTACAAGCGGGCCTTCGAATTAGTGAGGTGGTAAATTTAGAGATAGAGGATTATAG
AAAAATTGGTAGTGTAGGAACTATTACAATTCGTGAAGGTAAAGGTGGTAAGCTTGATGTAGTAAAAGCAGTAAAAGATATTTGTCGCGCCCTCGATGAG
TGGATTGAAGTTCGCGGACAATCTGTCGATAACACAACACTTTTTCTTTCCACTCATAAGAAAAAAATGACCAGACAAGCTATTCATAAACAAGTGAAAC
CACTTTTAGAACAAGTTTCACCAAAAGGCGGAATGACAACTCACAGTCTTAGACATACATATTGTAAAAGTCTTTTAGAAGTTAGTGGTGGTGATCTTGT
GTTAGTTGCACAAATGGCCAGACATGAATCTATTGAAACAACACGTCGATATGTTACTCCATCTGCAGAAGAACAATGGAATATTCTACAAAAGCTTAGT
GAAGAAAGATAAAAATCTCGTAGAGATTATACATCATATTTTTGGAAAAATGTAAATTTGAAATTGGAAGTTCCTATAACTAGAAAGGAGTTATGACATG
CTTACTATTCAAGAAACAGCTTATCCAAGGTTAAAAAGTAATCCTACACCTAAAGAACTAGATAAGCTATTTTCTCCTTCGTTAAAAGAATTAAATTGGA
CAAAAGCACATTCTCGTAATCCATCTTCTCAGTTGAACTTTTTAATTATGCTAAAAACTTTTCAGTGTTTAAACTATTTTGTTCCGATTACAGATGTTCC
CCTTGTTATTATCAAGCATATTGCTAGAACGTCTAATATTACTCTTTCTGGTAATGAAAAATGGGATTCTTATCATCGGACGGGAACCGGAAAACGTCAA
ATCACCATGATTCGGAACTATCGAAAAGCAAAAACATTTGATAATCAAGCCCGTCAAATTATGTTAACAGCAATGGAAAACGCAGTGTTAGAGAAAGATG
CGAAAAGTGATATTGTGAATATTGCGATTGACGAATTGGTCAAACATAGTTATGAATTACCTGCATTTCAGACGTTAGTAAAATCTGTAGACCATATCCA
TAGTATGGCTTATCGTACTTTATATAAACGAGTTGCAGATTCATTAAGCAATGAAGAAAAAGAAAAAATAGATACACTATTTCAACAGATTGATGGAGCT
ACTTATTCTGATTGGTATGCGATAAAACGAGACCCAGGCCGTCCTACACTAGAACAAATCAGGACATGGATTGCACGAAAAAATTGGATTAGTGACCGAA
AGGTGGGAAGTAATTTTTTTCAAAATCTACTTATCCCTCCTGCTAAGATAGAAAGATTAGCTGCAGAAGCAAAAACATTAGATGCGGCCCGTATGAAAGA
ACTTGAACAACATAAACGATACACATTAGCTATAGCTTTATTACATGTTCAATACGCCAAAACGATTGATGATATTGGAACAATGTATATCAAACGAGTT
GCCAAAGCTGAAAATAAAGCGGAAAGAGCTCTTTATGTTTTGAAAGAAAAGCGAGAAAAACAAACAGACGAACTCATTACGACATTACGTGATACCATCA
CTACTTATCAACTAGAAGGTTCTTCTGAAACACGATTACAATTATTAGAAACACTAATTGGTGGAAATCGTGGGCAACAAATTCTAGAGAACTGTGAAGA
ACATTTAGCCTATACTGGAAATAACTATTATTCTTTTATGTGGAGATATTTAAAAAGTAATCGTTCTGAATTAATTAAGATGTTGGAGTCATTAAAGTTT
AAATCAACTACACAAAATAAAGGACTAGAACAAGCTATTTCTTTCCTATTAAAAAATAAACATAAAAAATCTGAATGGATTTCAACTATCTACACGCGTA
AGAATGGAATGAATAAAAATGATTGGGAATCAGTTCCTCTTGTTGATTTAACCTGGATTCCTGAAGGCTGGTGGCGTTGGATTAGCTCTAATCGTAGAAA
AAATGTATATCCAAACAAAATTAATAGACGACACTTTGAAGCTTGTGTATTTTATCAAGTTAGAAATGAATTAAAATCCGGAGATTTATGTATTGAAGGT
AGCGAACAATACGCTGATTATCGAGAGCAATTAATATCTTGGGATAAATATCGCCAAAACTTACATACGTTTTGTGAACAAGCAGGCCTTCCAACAACAG
CTGGAGAATTTAAAAAACAGGTGTATGATAAGCTTGAAGAACTTGCGAAAAAAGTAGATACTTCTTTTCCAAAAAATAAAGCTGTTACCATTCGAAATGG
AGAACCTTTTATAACAAAATTAAAAAAGAAAAAAATATCACCGTTATTAAAGGCCGTTAGAAAACGAATTGAAGAGAAAATGGTACCTATTAATGTTTTA
GATTTATTGAGTGACACAGAGTATTGGTTAAATTGGACAAGATTTTTTGGTCCTATTTCTGGTTATGATGCCAAAATCGCTAAACCATCTCAACGGTATC
TAACAACCGCTTTTTGTTATGGTTGCAATTTAGGTCCTACTCAAGCAGCCCGTTCCCTCGGTACAGTGGATCGAAGGCAAATTTCTTGGATTAATGAACG
ACACGTTACTGAAGACAATATCCAGAAAGCCATTGAATGGTTAATTAATGCTTATAATAAATTTAATCTACCAAAATATTGGGGAACTGGAAATAGTGCG
TCAGCTGATGGAACAAAGTGGGATCTCTATGAACAAAATTTATTATCTGAAAATCATATTCGTTACGGTGGGTATGGTGGAATTGGATATTACCATGTTT
CAGATAATTATATCGCCTTATTCAGTCACTTTATACCTTGTGGTGTCTGGGAAGGTGTTTATATTTTGGATATTCTAATGAAAAATCAATCTGATATTCA
ACCCAATACACTGCATTCTGATACGCAAGGACAAAATGCACCGATATTTGGATTATCCTATTTATTAGGAATCCAACTTATGCCCCGGATTCGAAATTGG
AAAAATTTAAAATTATTAAGGCCACATAACGACTCTAATTATCAGCATATTAATGAACTATTTACAACTTCGGTAAATTGGAACATAATTGAAGATCATT
ATGAGGATATGTTACGTGTCGTGATGTCAATTAAAATGGGACGTATTCATCCTTCTACTATTCTTAATAAACTCAGTGCATATAGCAAGAAAAACAAATT
ATATCAAGCATTCCGTGAATTAGGTTGTGCAATCCGTACATTATTTTTATTGAAATATTTATCGGACGAGGAATTAAGAAGCACAATTCAAGCGGCTACA
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AATACAATCATCTAATTGCAAATTGTGTCATTTTTTATAACGTCTTTCAACTTACTCGTATCCTGCATGAATACATCCAAGAAGGAAATGAATTAGACGA
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GATATGGCCATTTCACCTAATGGATTAAAAGCTGCAAATTAAACAAAAATAGCCACAATCTATTTATAAATAGATTGTGGCTATTTTATTAAGTGGCCCC
AAAAAGAAGTAATCGTTGCCGTGCCCC
Protein section
ORF number : 7
ORF 1
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1416 bp | 471 aa | 1508 | 93 | - | No |
Annotation : trans-homoaconitate synthaseDescription :
ORF sequence :
MNKDITILDATLREGEQQCGVRFSKEDKITLLHMLEDFGIQLIEVGHPGISDEEEKVCREVAAAAKQADILMHARAKKEEVHAAYRAGADWVGIWASINP
ISLQTKYTNRSKDYVVNQVKQAIEEANTLGMKIRFTIEDASRTTWEDIAYLGQIAYEAGANRISLADTVGIWEPNECANIVKKAVEIFPCEIEVHLHNDL
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Blast result :ORF 2
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1065 bp | 354 aa | 2569 | 1505 | - | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MKMTWKSISVMGIFFVFLLSSCSNHQEVSKVEKTPEIIKEEYKIPQEDETLYLLHKSVNTQKQYTSDEIILFLEPFSVPTAAAFDVPNYSWMDEYAKKGY
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Blast result :ORF 3
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 438 bp | 145 aa | 3020 | 2583 | - | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MVSYLLLGTIFILALVVKDYALAIAASLLGVFFAMGQKTILHAIQQHAFPIGIFFLMLFLLVPITSGKISGDNIMKVITSPIGWGSILAGFIVSFIGGKG
VGVLPMNPTILLGVLIGTLMAVLFTKGLPAGLIIAAGIIAIISMK
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Blast result :ORF 4
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 867 bp | 288 aa | 3901 | 3035 | - | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MFTRNLNTQNIYEESFTRNIGVISIEEQEKLKNARVTVVGAGGVGGITLIQLARMGIGKLHVIDQDVFEASNINRQMLSSISKLGKPKALVALETLKDIN
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Blast result :ORF 5
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 843 bp | 280 aa | 4757 | 3915 | - | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MDTYYWEMVKKNIGVYSRAEQECLRNKRVIIFGLGGVGGYEAILFARMGVGHITGIDPDEFEISNINRQMLALSSVVGKPKATVAEQVVKDIYPYISTNF
IQTKVDEDNVVELMKGHDIVIEAVDDMPSRVIIHRTARELGIPSVGMSGSPPTRGFVSTFFPNGIPYEEALNVSVVGSKLTDSKLRQQIADIKKKRAWYS
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Blast result :ORF 6
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 891 bp | 296 aa | 5022 | 5912 | + | No |
AG : Tn3 resolvase
ORF sequence :
MDFKTWLKNEGKREQTIQVYVRSVRQFMEWLQISHERNWNPDEISAKVIHEWIHHMQTIEKVAKPTINKRIASLKVYWSYLIEQRIAIYDPTKKIKIKRI
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SVDNTTLFLSTHKKKMTRQAIHKQVKPLLEQVSPKGGMTTHSLRHTYCKSLLEVSGGDLVLVAQMARHESIETTRRYVTPSAEEQWNILQKLSEER
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Blast result :ORF 7
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 3045 bp | 1014 aa | 5998 | 9042 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MLTIQETAYPRLKSNPTPKELDKLFSPSLKELNWTKAHSRNPSSQLNFLIMLKTFQCLNYFVPITDVPLVIIKHIARTSNITLSGNEKWDSYHRTGTGKR
QITMIRNYRKAKTFDNQARQIMLTAMENAVLEKDAKSDIVNIAIDELVKHSYELPAFQTLVKSVDHIHSMAYRTLYKRVADSLSNEEKEKIDTLFQQIDG
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FDMAISPNGLKAAN
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WKNLKLLRPHNDSNYQHINELFTTSVNWNIIEDHYEDMLRVVMSIKMGRIHPSTILNKLSAYSKKNKLYQAFRELGCAIRTLFLLKYLSDEELRSTIQAA
TNKSESFNGFTKWLFFGGDGVIAENHRERQRKIIKYNHLIANCVIFYNVFQLTRILHEYIQEGNELDEEVLSDLSPYLTFHINRFGKYGLDDNRQPPDIQ
FDMAISPNGLKAAN
Blast result :
Comments
TnBth2 is 61% aa similar to TnXax1.
References
1] ISfinder annotation (2017)
2] Hollensteiner,J., Wemheuer,F., Harting,R., Kolarzyk,A., Diaz-Valerio,S., Poehlein,A., Brzuszkiewicz,E., Nesemann,K., Braus-Stromeyer,S., Braus,G., Daniel,R. and Liesegang,H. (2016) Direct GenBank submission.
2] Hollensteiner,J., Wemheuer,F., Harting,R., Kolarzyk,A., Diaz-Valerio,S., Poehlein,A., Brzuszkiewicz,E., Nesemann,K., Braus-Stromeyer,S., Braus,G., Daniel,R. and Liesegang,H. (2016) Direct GenBank submission.