ISfinder Mirror Site

ISBth19

Family IS1595
Group ISPna2

MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)

Accession number	Transposition	Origin	Host
CP009650	ND	Bacillus thuringiensis	Bacillus thuringiensis Al Hakam plasmid pBTZ_1

DNA section

IS Length : 2004 bp

Ends

IR Length : 22/26

IRL : GGCTATGTTTTAAATAGATGTTGAAAATTAATATATTAATAGAAGATATA
IRR : GGCGATGTTTTAAAACAATGTTGAAATTATATAACTTTTAAGGGAAGACA

Insertion site

Left flank	Direct repeat	Right flank	DR Length
AAAGCGATTTA	TATTATTA	AAGATTATTTT	8

DNA sequence

GGCTATGTTTTAAATAGATGTTGAAAATTAATATATTAATAGAAGATATACTATAATTAGGCCATATATACATACAGGTTTGGAGGTATTATTATGGCAA
GTGTTAATTCTTTGATTTCAGATATTCAAAAACTATCAGTATCTCAACAAGAACAGTTGCTTTCCTATTTAGAAGACCTACTTGTATTAGGTACACAAGT
AGGTCAAGTAACACAAGAAGTCAAGGAATTTAGATTTGCCAAGGGAAAAACCTGCCCACATTGTAGTGCTGAAACTGTATCAAGAAACGGCAAGTATAAA
GGGAAGCAACGATATATTTGTAAATCCTGCAATAAGACTTTTACTGACTTCACAAACTCTGCCACTTACAAAAGCAAGAAAACATTAGATAAATGGCTTA
AATACGCTAAATGTATGATTGCAGGTTATTCCATTAGAAAGAGTGCTAAAATTGTAGAGATTAATATTGCAACAAGTTTCTTTTGGAGACACAAAATACT
TGATTGTATAAGGTCATTTTTTGGTGTAGGCTCTGTTGAGGGTGTAATTGAGGCTGATGAAGTATTCTTTGCAGAGAGTTTCAAAGGTACAAAACCTTCT
AAAATGCCGAGAAAATCTCGTAAAAGAGGAAAACAGATTAAAAAGAGAGGTATATCTAACGAACAGGTTTGTATTGCTACTGCTATTGATAGACAGGGTA
ATCTAATTATGGAGTTACTATGTAGAGGTAGAATGACACACCAAGAATTAGAAAGACTCTATGACGGTCGTGTAGGGGATAACTCTATCTTTTGTACTGA
CAGTCATAAGAGTTATGTTCAGATTGCCAAAGATTTTTCATTGGAACATAAGCGTATACAAAGAGGAAAACATAAAGAAGGAATTTACCATATTCAACAC
ATTAATGCTGTACACAGCAAATTAAAAAAGTGGATGAATAAGTTTAATGGTGTTGCAACTAAATATATCAGCAATTATTTGTATTGGTTTAAATGGCTAC
AATTATTTGAAACTGACAAAGAAGTTGTTAAAATCAAGAACTTTATGGTTCAATGCAATGTAGCCCATGCTTATACAAGAATAACAGATTTTAAAGAAAG
AGAGCCAATATTTATTTAGGTATATACATTTGTAATATTAGGAATGACGAATTATTTGTATTTCATGGAGGATAAATTGTAATGATGAAAAATAATTTTA
AAATAGAAAATATTCCAGCGGTTTTGTGGGGTGACAAATCAGATAAGTTATTTGTGGTGGTGCATGGTAACATGTCAAACAAGGCAGATGACTCAATTAT
TGTATTTGCAGAAGAAGCAACAGCAGTAGGTTATCAAGTGCTTAGTTTTGATTTACCTCAACATGGTGACCGTAAGGATGATACTTATCTTTGCAAAGTT
CAAAACTGTGTCCAAGACCTTAATACAATTATGACCTATGCAAAATCGTTATCAAATAATATAAGCATTTTTGCTTGTAGCATGGGAGCGTATTTTAGTC
TATTAGAATATAGCCATGAGCCGTTGAAGCAGTGCTTGTTTCTCTCTCCCGTGGTAAATATGGAACGTATCATAAATAATATGATGACATGGTTTAACGT
AAGTGAGAGTAGACTAAAAATAGAGAAAGAAATTTCTACACCTATTGGACAAACTCTCTATTGGGATTACTACTGTTATGTGAAAGAACATCCTATTGTT
GCTTGGAATAATCCAACTTCAATTCTCTATGGTTCAGAAGATAACTTATGTGAGTTTGACGTTGTATCTGAATTTAATAAACGTTTTAACTGTAATTTGC
AAGTAATGGAGAATGGAGAACACTATTTCCATACTGAGGAACAGTTGCAGTATTTCAGACAATGGCTGAAAAAACATATATACGTTAAATGATAATAAAA
TAAAAAATGATTGATGTATAATCTTCTTTAAAAGCGAATTAAGGGAAGTCAAAATGTCTTCCCTTAAAAGTTATATAATTTCAACATTGTTTTAAAACAT
CGCC

Protein section

ORF number : 2

ORF 1

Length		Begin	End	Strand	Fusion ORF
1026 bp	341 aa	94	1119	+	No

ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MASVNSLISDIQKLSVSQQEQLLSYLEDLLVLGTQVGQVTQEVKEFRFAKGKTCPHCSAETVSRNGKYKGKQRYICKSCNKTFTDFTNSATYKSKKTLDK
WLKYAKCMIAGYSIRKSAKIVEINIATSFFWRHKILDCIRSFFGVGSVEGVIEADEVFFAESFKGTKPSKMPRKSRKRGKQIKKRGISNEQVCIATAIDR
QGNLIMELLCRGRMTHQELERLYDGRVGDNSIFCTDSHKSYVQIAKDFSLEHKRIQRGKHKEGIYHIQHINAVHSKLKKWMNKFNGVATKYISNYLYWFK
WLQLFETDKEVVKIKNFMVQCNVAHAYTRITDFKEREPIFI

Blast result :

ORF 2

Length		Begin	End	Strand	Fusion ORF
711 bp	236 aa	1182	1892	+	No

ORF function : Passenger Gene
Annotation : Alpha/beta hydrolase family proteinDescription :

ORF sequence :

MMKNNFKIENIPAVLWGDKSDKLFVVVHGNMSNKADDSIIVFAEEATAVGYQVLSFDLPQHGDRKDDTYLCKVQNCVQDLNTIMTYAKSLSNNISIFACS
MGAYFSLLEYSHEPLKQCLFLSPVVNMERIINNMMTWFNVSESRLKIEKEISTPIGQTLYWDYYCYVKEHPIVAWNNPTSILYGSEDNLCEFDVVSEFNK
RFNCNLQVMENGEHYFHTEEQLQYFRQWLKKHIYVK

Blast result :

Comments

ISBth19 is 88% (transposase) aa similar to ISClsp6.

References

1] ISfinder annotation (2017)
2] Johnson,S.L., Daligault,H.E., Davenport,K.W., Jaissle,J., Frey,K.G., Ladner,J.T., Broomall,S.M., Bishop-Lilly,K.A., Bruce,D.C., Gibbons,H.S., Coyne,S.R., Lo,C.C., Meincke,L., Munk,A.C., Koroleva,G.I., Rosenzweig,C.N., Palacios,G.F., Redden,C.L., Minogue,T.D. and Chain,P.S. (2015) Genome Announc 3 (2).