ISBsp7

  • Family IS1595
  • Group ISPna2
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
FOML01000001 ND Bacillus sp.
Bacillus sp. OV194
DNA section
IS Length : 2838 bp

Ends


IR Length : 24/29

IRL : GGCTCTGTTAAAGGATTATGTTGATATTGCCTTCCTGTACAATCATTGAT
IRR : GGCTCTGTTATATAATCATGTTGATAATGAGACATTTAATTTAAGACACA

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
CTATTTCTTTTACAAAAAAGAAGTGCAG8

DNA sequence

GGCTCTGTTAAAGGATTATGTTGATATTGCCTTCCTGTACAATCATTGATATAGTTTATTTAATTAACACGAACGTATGTACGAGAGGTTTTTCCATGGG
TTCCAAAAGTTTTCGAAATCTTTTAAAATACGTTTCTTCATTAGACAAACCACACCAAGAACGAATTTATTATGAGTTACAACGTGCTATATTCCCATCG
GGGGCATCTATTCATGTCATCGATGAACTTCGTGACAAGCGTTTTGCTAAGGGTTTTAATTGTGCACATTGTAACGGCAACTCTGTTGTTCGTTTTGGCA
AATATAATGGTCGTCAACGTTATAAATGTAAAGAATGCGGAAAAACGTTTAGCGATTTAACTAATTCTCCTTTACAAGGTACCCATTATCCAGAGCGATG
GATCAAGTTTATCGATTGTATGTTACAAGGGATGTCTTTAAGAAAGTCATCCGAACTGCTTGGAGTGCACCATGTTACGCTATTTTACTGGCGGCATAAG
GTTCTTACTGCCTTGGAACAAATGACAATCGAACAATTTGAAGGCATTCTAGAAGTCGATGAAACTTATTTTCTTCACTCTCAAAAGGGACAACGGAACA
TTAAAGGAAGAAAGCCTCGCAAAAAAGGAGGCGTATCTCATTTTAGAGGAATAAGCAAGGAACAAGTCTGTGTTCTTGTAGCTCGTGACCGAAATAAAAA
TACGATTTCTAAAGTCGCTTGTATGGGGCGTATTGAAAAAACTCAAGTGAAAAAAACCATCGGCAGCTTAATTTCTAAGGATACAATCCTTTGTACAGAT
GGTTGGAGAGGTTATAAAACTTTTGCCAAGGAAAAGGGACTCGAACACTATCGTATTGATACAAACAAAACTGGGTATGTCATTAAAGGTATTTACCACA
TTCAAAATGTGAATAGCTACCATGGGCGGTTGAAACAATGGTTACACCGATTTAAGGGTGTTGCAACAAAATATCTCAACCATTACCTAGCGTGGTTCCA
ATTCCTTGAAACAATCGAATTTGAGGCTACAAAAGCAAATCTGAAGGATATGCTTATTTATGCATGCCTTTTCCCAGTCGAAGAATCTATGATAGTCTCA
GAAAGTCAAAGTTTACTGTTGCATAGGCTTATAAAAAGGAAATTTTGTATACTACCCACTATGTTACATTATCAGAATTATAAAGCAAGATTTCGAATGA
AGGAACTATATCTTTATTGTTACAATGTAGTAGTGAAATGTGAGGTGAACATATGAGTTTATTAAGTGGAGAAGTCATGTGGGACGCAGTAATAAATTGC
AACAAAGGATATGATGGTCTCTTCTATTATGCAGTTAAGTCTACTGGAATTTTTTGCAAACCTTCTTGTAAATCGAAAACTCCCTTGAAGGAAAATGTTT
TGTTCTATCCTTCTGTCTCTTTAGCTGTTCTAGATGGATACCGTCTTTGTAAAAGATGTCGTCCACACCTACTTCAATCGAATGAAGAAGAAATTGTATT
TTCAGTCAAACAAGTGATTGAACGGGAATATCGAAATTTTATAACATTGGAGCAACTTGCTTTGCAAGTAGGTGTAAGTAAATACCATCTCCAAAGGGTG
TTTAAATTAAACACAGGGACATCTCCATTGGAGTACATTACCAAGCTTAGAATGGACGAAGCGATGCTGCGGCTTGAAACCACAAAAGAAACTGTCACAG
AAATAGCCCATGTTCTTGGTTACAAAAGTTCTGCTCATTTTTCAAGTGTATTCCAACATCATATTGGTTGCACTCCATCGAAATATAGAAATCGGAGGTA
AATTATGAAATTACAAGATATAATGGCTTTATTCGGACTTGCTGCACTATGGGGAGCTTCCTTTTTATTTATTCGGATAGCTGCCCCAGTATTCGGACCA
CTCCTCACTATTCAGGGGAGAGTCACTATTGCAGCTGCTGCTTTGATAATATTTTTAACTAGCACTCGGCGTTCAGCACATTTTAAAAAGAGATGGAAAC
AATATTTAATTATTGGGGCTTTAAATGCGGCAATTCCGTTTACTCTTATTGCAACAGCCGAACTTACTTTACCAGCTTCCATGTCAGCCATTCTCAATTC
CCTAACGCCTTTGTTCACAGCTTTGGTTGTATGGGGATGGATGAAAGAAGCACTCAGTATTCGGAAATGGTTTGGTATTGTTGTTGGTATAATAGGAGTG
GGCATCTTAGTAGGGTGGAGTTCCCTCCCTTTTACATCTGAGACCATCGTTGCTATTGGTCTTTCAGTTCTTTCAACTATTTCATATGGTTTTGCAGGTG
TCTATGCAAAAAAAGCTTTTGCAGGAGTTCCCCCGCTTGAGCTTGCTACGGGACAACAAGCTGGAGCAGCCGTTCTTTTAATACCCTTCACATTTTTTCA
TTTGCCTACTTCAACAGATAGAATACCCACCACTGCCGTATTATCTGTTGTTGGATTAGCTCTATTTTGTACAGCTATTGCATACCTTTTATATTTTTAT
CTCATTGACCGTGTTGGACCAACCAAAACATTGAGTGTCACCTTCCTCATTCCTGTATTCGGAATCATTTGGGGCATGATTTTTCTCCATGAAAAACTTA
CAATCGGTATGCTAATAGGTCTAATTATCATTTCAGGCAGTGTATTTCTTATTTCAGATGTCCGATTGAGGAAGAGGGCATTAGTCAAAGAAGCGGAATC
ATAACAATAGTCACTCTAAAAAAACTGTTGGCTTATATATCAACAGTCGTAATCGCTTGATAATTCCAAGCGATTTTTTGTTTATTCTTGTGTCTTAAAT
TAAATGTCTCATTATCAACATGATTATATAACAGAGCC
Protein section
ORF number : 3

 

ORF 2
LengthBeginEndStrandFusion ORF
549 bp182 aa12531801+No
ORF function : Passenger Gene
Annotation : AraC family transcriptional regulatorDescription : Transcriptional Regulator factor

ORF sequence :

MSLLSGEVMWDAVINCNKGYDGLFYYAVKSTGIFCKPSCKSKTPLKENVLFYPSVSLAVLDGYRLCKRCRPHLLQSNEEEIVFSVKQVIEREYRNFITLE
QLALQVGVSKYHLQRVFKLNTGTSPLEYITKLRMDEAMLRLETTKETVTEIAHVLGYKSSAHFSSVFQHHIGCTPSKYRNRR

 

Blast result :
ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
1161 bp386 aa961256+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MGSKSFRNLLKYVSSLDKPHQERIYYELQRAIFPSGASIHVIDELRDKRFAKGFNCAHCNGNSVVRFGKYNGRQRYKCKECGKTFSDLTNSPLQGTHYPE
RWIKFIDCMLQGMSLRKSSELLGVHHVTLFYWRHKVLTALEQMTIEQFEGILEVDETYFLHSQKGQRNIKGRKPRKKGGVSHFRGISKEQVCVLVARDRN
KNTISKVACMGRIEKTQVKKTIGSLISKDTILCTDGWRGYKTFAKEKGLEHYRIDTNKTGYVIKGIYHIQNVNSYHGRLKQWLHRFKGVATKYLNHYLAW
FQFLETIEFEATKANLKDMLIYACLFPVEESMIVSESQSLLLHRLIKRKFCILPTMLHYQNYKARFRMKELYLYCYNVVVKCEVNI

 

Blast result :
ORF 3
LengthBeginEndStrandFusion ORF
900 bp299 aa18052704+No
ORF function : Passenger Gene
Annotation : Threonine/homoserine efflux transporter RhtADescription :

ORF sequence :

MKLQDIMALFGLAALWGASFLFIRIAAPVFGPLLTIQGRVTIAAAALIIFLTSTRRSAHFKKRWKQYLIIGALNAAIPFTLIATAELTLPASMSAILNSL
TPLFTALVVWGWMKEALSIRKWFGIVVGIIGVGILVGWSSLPFTSETIVAIGLSVLSTISYGFAGVYAKKAFAGVPPLELATGQQAGAAVLLIPFTFFHL
PTSTDRIPTTAVLSVVGLALFCTAIAYLLYFYLIDRVGPTKTLSVTFLIPVFGIIWGMIFLHEKLTIGMLIGLIIISGSVFLISDVRLRKRALVKEAES

 

Blast result :
Comments
ISBsp7 is 76% aa similar to ISBko1.
References
1] ISfinder annotation (2016)
2] Varghese,N. and Submissions,S. (2016) Direct GenBank submission.