ISBsp7
- Family IS1595
- Group ISPna2
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
FOML01000001 | ND | Bacillus sp. | Bacillus sp. OV194 |
DNA section
IS Length : 2838 bp
Ends
IR Length : 24/29
IRL : GGCTCTGTTAAAGGATTATGTTGATATTGCCTTCCTGTACAATCATTGAT
IRR : GGCTCTGTTATATAATCATGTTGATAATGAGACATTTAATTTAAGACACA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
CTATTTCTTT | TACAAAAA | AGAAGTGCAG | 8 |
DNA sequence
GGCTCTGTTAAAGGATTATGTTGATATTGCCTTCCTGTACAATCATTGATATAGTTTATTTAATTAACACGAACGTATGTACGAGAGGTTTTTCCATGGG
TTCCAAAAGTTTTCGAAATCTTTTAAAATACGTTTCTTCATTAGACAAACCACACCAAGAACGAATTTATTATGAGTTACAACGTGCTATATTCCCATCG
GGGGCATCTATTCATGTCATCGATGAACTTCGTGACAAGCGTTTTGCTAAGGGTTTTAATTGTGCACATTGTAACGGCAACTCTGTTGTTCGTTTTGGCA
AATATAATGGTCGTCAACGTTATAAATGTAAAGAATGCGGAAAAACGTTTAGCGATTTAACTAATTCTCCTTTACAAGGTACCCATTATCCAGAGCGATG
GATCAAGTTTATCGATTGTATGTTACAAGGGATGTCTTTAAGAAAGTCATCCGAACTGCTTGGAGTGCACCATGTTACGCTATTTTACTGGCGGCATAAG
GTTCTTACTGCCTTGGAACAAATGACAATCGAACAATTTGAAGGCATTCTAGAAGTCGATGAAACTTATTTTCTTCACTCTCAAAAGGGACAACGGAACA
TTAAAGGAAGAAAGCCTCGCAAAAAAGGAGGCGTATCTCATTTTAGAGGAATAAGCAAGGAACAAGTCTGTGTTCTTGTAGCTCGTGACCGAAATAAAAA
TACGATTTCTAAAGTCGCTTGTATGGGGCGTATTGAAAAAACTCAAGTGAAAAAAACCATCGGCAGCTTAATTTCTAAGGATACAATCCTTTGTACAGAT
GGTTGGAGAGGTTATAAAACTTTTGCCAAGGAAAAGGGACTCGAACACTATCGTATTGATACAAACAAAACTGGGTATGTCATTAAAGGTATTTACCACA
TTCAAAATGTGAATAGCTACCATGGGCGGTTGAAACAATGGTTACACCGATTTAAGGGTGTTGCAACAAAATATCTCAACCATTACCTAGCGTGGTTCCA
ATTCCTTGAAACAATCGAATTTGAGGCTACAAAAGCAAATCTGAAGGATATGCTTATTTATGCATGCCTTTTCCCAGTCGAAGAATCTATGATAGTCTCA
GAAAGTCAAAGTTTACTGTTGCATAGGCTTATAAAAAGGAAATTTTGTATACTACCCACTATGTTACATTATCAGAATTATAAAGCAAGATTTCGAATGA
AGGAACTATATCTTTATTGTTACAATGTAGTAGTGAAATGTGAGGTGAACATATGAGTTTATTAAGTGGAGAAGTCATGTGGGACGCAGTAATAAATTGC
AACAAAGGATATGATGGTCTCTTCTATTATGCAGTTAAGTCTACTGGAATTTTTTGCAAACCTTCTTGTAAATCGAAAACTCCCTTGAAGGAAAATGTTT
TGTTCTATCCTTCTGTCTCTTTAGCTGTTCTAGATGGATACCGTCTTTGTAAAAGATGTCGTCCACACCTACTTCAATCGAATGAAGAAGAAATTGTATT
TTCAGTCAAACAAGTGATTGAACGGGAATATCGAAATTTTATAACATTGGAGCAACTTGCTTTGCAAGTAGGTGTAAGTAAATACCATCTCCAAAGGGTG
TTTAAATTAAACACAGGGACATCTCCATTGGAGTACATTACCAAGCTTAGAATGGACGAAGCGATGCTGCGGCTTGAAACCACAAAAGAAACTGTCACAG
AAATAGCCCATGTTCTTGGTTACAAAAGTTCTGCTCATTTTTCAAGTGTATTCCAACATCATATTGGTTGCACTCCATCGAAATATAGAAATCGGAGGTA
AATTATGAAATTACAAGATATAATGGCTTTATTCGGACTTGCTGCACTATGGGGAGCTTCCTTTTTATTTATTCGGATAGCTGCCCCAGTATTCGGACCA
CTCCTCACTATTCAGGGGAGAGTCACTATTGCAGCTGCTGCTTTGATAATATTTTTAACTAGCACTCGGCGTTCAGCACATTTTAAAAAGAGATGGAAAC
AATATTTAATTATTGGGGCTTTAAATGCGGCAATTCCGTTTACTCTTATTGCAACAGCCGAACTTACTTTACCAGCTTCCATGTCAGCCATTCTCAATTC
CCTAACGCCTTTGTTCACAGCTTTGGTTGTATGGGGATGGATGAAAGAAGCACTCAGTATTCGGAAATGGTTTGGTATTGTTGTTGGTATAATAGGAGTG
GGCATCTTAGTAGGGTGGAGTTCCCTCCCTTTTACATCTGAGACCATCGTTGCTATTGGTCTTTCAGTTCTTTCAACTATTTCATATGGTTTTGCAGGTG
TCTATGCAAAAAAAGCTTTTGCAGGAGTTCCCCCGCTTGAGCTTGCTACGGGACAACAAGCTGGAGCAGCCGTTCTTTTAATACCCTTCACATTTTTTCA
TTTGCCTACTTCAACAGATAGAATACCCACCACTGCCGTATTATCTGTTGTTGGATTAGCTCTATTTTGTACAGCTATTGCATACCTTTTATATTTTTAT
CTCATTGACCGTGTTGGACCAACCAAAACATTGAGTGTCACCTTCCTCATTCCTGTATTCGGAATCATTTGGGGCATGATTTTTCTCCATGAAAAACTTA
CAATCGGTATGCTAATAGGTCTAATTATCATTTCAGGCAGTGTATTTCTTATTTCAGATGTCCGATTGAGGAAGAGGGCATTAGTCAAAGAAGCGGAATC
ATAACAATAGTCACTCTAAAAAAACTGTTGGCTTATATATCAACAGTCGTAATCGCTTGATAATTCCAAGCGATTTTTTGTTTATTCTTGTGTCTTAAAT
TAAATGTCTCATTATCAACATGATTATATAACAGAGCC
TTCCAAAAGTTTTCGAAATCTTTTAAAATACGTTTCTTCATTAGACAAACCACACCAAGAACGAATTTATTATGAGTTACAACGTGCTATATTCCCATCG
GGGGCATCTATTCATGTCATCGATGAACTTCGTGACAAGCGTTTTGCTAAGGGTTTTAATTGTGCACATTGTAACGGCAACTCTGTTGTTCGTTTTGGCA
AATATAATGGTCGTCAACGTTATAAATGTAAAGAATGCGGAAAAACGTTTAGCGATTTAACTAATTCTCCTTTACAAGGTACCCATTATCCAGAGCGATG
GATCAAGTTTATCGATTGTATGTTACAAGGGATGTCTTTAAGAAAGTCATCCGAACTGCTTGGAGTGCACCATGTTACGCTATTTTACTGGCGGCATAAG
GTTCTTACTGCCTTGGAACAAATGACAATCGAACAATTTGAAGGCATTCTAGAAGTCGATGAAACTTATTTTCTTCACTCTCAAAAGGGACAACGGAACA
TTAAAGGAAGAAAGCCTCGCAAAAAAGGAGGCGTATCTCATTTTAGAGGAATAAGCAAGGAACAAGTCTGTGTTCTTGTAGCTCGTGACCGAAATAAAAA
TACGATTTCTAAAGTCGCTTGTATGGGGCGTATTGAAAAAACTCAAGTGAAAAAAACCATCGGCAGCTTAATTTCTAAGGATACAATCCTTTGTACAGAT
GGTTGGAGAGGTTATAAAACTTTTGCCAAGGAAAAGGGACTCGAACACTATCGTATTGATACAAACAAAACTGGGTATGTCATTAAAGGTATTTACCACA
TTCAAAATGTGAATAGCTACCATGGGCGGTTGAAACAATGGTTACACCGATTTAAGGGTGTTGCAACAAAATATCTCAACCATTACCTAGCGTGGTTCCA
ATTCCTTGAAACAATCGAATTTGAGGCTACAAAAGCAAATCTGAAGGATATGCTTATTTATGCATGCCTTTTCCCAGTCGAAGAATCTATGATAGTCTCA
GAAAGTCAAAGTTTACTGTTGCATAGGCTTATAAAAAGGAAATTTTGTATACTACCCACTATGTTACATTATCAGAATTATAAAGCAAGATTTCGAATGA
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AACAAAGGATATGATGGTCTCTTCTATTATGCAGTTAAGTCTACTGGAATTTTTTGCAAACCTTCTTGTAAATCGAAAACTCCCTTGAAGGAAAATGTTT
TGTTCTATCCTTCTGTCTCTTTAGCTGTTCTAGATGGATACCGTCTTTGTAAAAGATGTCGTCCACACCTACTTCAATCGAATGAAGAAGAAATTGTATT
TTCAGTCAAACAAGTGATTGAACGGGAATATCGAAATTTTATAACATTGGAGCAACTTGCTTTGCAAGTAGGTGTAAGTAAATACCATCTCCAAAGGGTG
TTTAAATTAAACACAGGGACATCTCCATTGGAGTACATTACCAAGCTTAGAATGGACGAAGCGATGCTGCGGCTTGAAACCACAAAAGAAACTGTCACAG
AAATAGCCCATGTTCTTGGTTACAAAAGTTCTGCTCATTTTTCAAGTGTATTCCAACATCATATTGGTTGCACTCCATCGAAATATAGAAATCGGAGGTA
AATTATGAAATTACAAGATATAATGGCTTTATTCGGACTTGCTGCACTATGGGGAGCTTCCTTTTTATTTATTCGGATAGCTGCCCCAGTATTCGGACCA
CTCCTCACTATTCAGGGGAGAGTCACTATTGCAGCTGCTGCTTTGATAATATTTTTAACTAGCACTCGGCGTTCAGCACATTTTAAAAAGAGATGGAAAC
AATATTTAATTATTGGGGCTTTAAATGCGGCAATTCCGTTTACTCTTATTGCAACAGCCGAACTTACTTTACCAGCTTCCATGTCAGCCATTCTCAATTC
CCTAACGCCTTTGTTCACAGCTTTGGTTGTATGGGGATGGATGAAAGAAGCACTCAGTATTCGGAAATGGTTTGGTATTGTTGTTGGTATAATAGGAGTG
GGCATCTTAGTAGGGTGGAGTTCCCTCCCTTTTACATCTGAGACCATCGTTGCTATTGGTCTTTCAGTTCTTTCAACTATTTCATATGGTTTTGCAGGTG
TCTATGCAAAAAAAGCTTTTGCAGGAGTTCCCCCGCTTGAGCTTGCTACGGGACAACAAGCTGGAGCAGCCGTTCTTTTAATACCCTTCACATTTTTTCA
TTTGCCTACTTCAACAGATAGAATACCCACCACTGCCGTATTATCTGTTGTTGGATTAGCTCTATTTTGTACAGCTATTGCATACCTTTTATATTTTTAT
CTCATTGACCGTGTTGGACCAACCAAAACATTGAGTGTCACCTTCCTCATTCCTGTATTCGGAATCATTTGGGGCATGATTTTTCTCCATGAAAAACTTA
CAATCGGTATGCTAATAGGTCTAATTATCATTTCAGGCAGTGTATTTCTTATTTCAGATGTCCGATTGAGGAAGAGGGCATTAGTCAAAGAAGCGGAATC
ATAACAATAGTCACTCTAAAAAAACTGTTGGCTTATATATCAACAGTCGTAATCGCTTGATAATTCCAAGCGATTTTTTGTTTATTCTTGTGTCTTAAAT
TAAATGTCTCATTATCAACATGATTATATAACAGAGCC
Protein section
ORF number : 3
ORF 2
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
549 bp | 182 aa | 1253 | 1801 | + | No |
Annotation : AraC family transcriptional regulatorDescription : Transcriptional Regulator factor
ORF sequence :
MSLLSGEVMWDAVINCNKGYDGLFYYAVKSTGIFCKPSCKSKTPLKENVLFYPSVSLAVLDGYRLCKRCRPHLLQSNEEEIVFSVKQVIEREYRNFITLE
QLALQVGVSKYHLQRVFKLNTGTSPLEYITKLRMDEAMLRLETTKETVTEIAHVLGYKSSAHFSSVFQHHIGCTPSKYRNRR
QLALQVGVSKYHLQRVFKLNTGTSPLEYITKLRMDEAMLRLETTKETVTEIAHVLGYKSSAHFSSVFQHHIGCTPSKYRNRR
Blast result :ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1161 bp | 386 aa | 96 | 1256 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MGSKSFRNLLKYVSSLDKPHQERIYYELQRAIFPSGASIHVIDELRDKRFAKGFNCAHCNGNSVVRFGKYNGRQRYKCKECGKTFSDLTNSPLQGTHYPE
RWIKFIDCMLQGMSLRKSSELLGVHHVTLFYWRHKVLTALEQMTIEQFEGILEVDETYFLHSQKGQRNIKGRKPRKKGGVSHFRGISKEQVCVLVARDRN
KNTISKVACMGRIEKTQVKKTIGSLISKDTILCTDGWRGYKTFAKEKGLEHYRIDTNKTGYVIKGIYHIQNVNSYHGRLKQWLHRFKGVATKYLNHYLAW
FQFLETIEFEATKANLKDMLIYACLFPVEESMIVSESQSLLLHRLIKRKFCILPTMLHYQNYKARFRMKELYLYCYNVVVKCEVNI
RWIKFIDCMLQGMSLRKSSELLGVHHVTLFYWRHKVLTALEQMTIEQFEGILEVDETYFLHSQKGQRNIKGRKPRKKGGVSHFRGISKEQVCVLVARDRN
KNTISKVACMGRIEKTQVKKTIGSLISKDTILCTDGWRGYKTFAKEKGLEHYRIDTNKTGYVIKGIYHIQNVNSYHGRLKQWLHRFKGVATKYLNHYLAW
FQFLETIEFEATKANLKDMLIYACLFPVEESMIVSESQSLLLHRLIKRKFCILPTMLHYQNYKARFRMKELYLYCYNVVVKCEVNI
Blast result :ORF 3
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
900 bp | 299 aa | 1805 | 2704 | + | No |
Annotation : Threonine/homoserine efflux transporter RhtADescription :
ORF sequence :
MKLQDIMALFGLAALWGASFLFIRIAAPVFGPLLTIQGRVTIAAAALIIFLTSTRRSAHFKKRWKQYLIIGALNAAIPFTLIATAELTLPASMSAILNSL
TPLFTALVVWGWMKEALSIRKWFGIVVGIIGVGILVGWSSLPFTSETIVAIGLSVLSTISYGFAGVYAKKAFAGVPPLELATGQQAGAAVLLIPFTFFHL
PTSTDRIPTTAVLSVVGLALFCTAIAYLLYFYLIDRVGPTKTLSVTFLIPVFGIIWGMIFLHEKLTIGMLIGLIIISGSVFLISDVRLRKRALVKEAES
TPLFTALVVWGWMKEALSIRKWFGIVVGIIGVGILVGWSSLPFTSETIVAIGLSVLSTISYGFAGVYAKKAFAGVPPLELATGQQAGAAVLLIPFTFFHL
PTSTDRIPTTAVLSVVGLALFCTAIAYLLYFYLIDRVGPTKTLSVTFLIPVFGIIWGMIFLHEKLTIGMLIGLIIISGSVFLISDVRLRKRALVKEAES
Blast result :
Comments
ISBsp7 is 76% aa similar to ISBko1.
References
1] ISfinder annotation (2016)
2] Varghese,N. and Submissions,S. (2016) Direct GenBank submission.
2] Varghese,N. and Submissions,S. (2016) Direct GenBank submission.