ISBce20
- Family IS1595
- Group ISPna2
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
LJKE01000041.1 | ND | Bacillus cereus | Bacillus cereus Bacillus cereus B4088 |
DNA section
IS Length : 1939 bp
Ends
IR Length : 24/29
IRL : GGCTATGTTAAATaactctgttgatatttgattaaaccaaactaatgttc
IRR : GGCTTTGTTAAATtataatgttgatattttcgataaaaatgacttattct
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
ACTATGTTATTT | taaatgtt | AAAAATGAAGGAG | 8 |
DNA sequence
GGCTATGTTAAATAACTCTGTTGATATTTGATTAAACCAAACTAATGTTCTACAATAAATGGACGAACATTAGTTTTGAGGGCTTTAAATGACGTTAAGG
GAATTAATAGCAGAGATAAAAAAATTAAATTCAGCAGAACAACATAGATTAAAAGAATTTTTTATCAGTTCACTTGCGTCATTTTCAGCAAGTGAACCTG
TATTTCAAGAAGTAACTGAACGAAAAAATAAAGATGGCTATACTTGTGTGAGTTGTGGCTCTAAACAAGTTGTGCGTTTCGGTAAGTATATGGTAAAACT
CGGTCTTAAGGAGATTGAACGCCAACGATACCGCTGTAAATATTGCCGAAAAACTTTTACAGATGTAACCTCGACACCCCTTTACCGTACTCATAAACCT
GATAAATGGTTGGATTTTATTAAATGTATGTTGGAAGGCTATTCTCTTCGTAAATCAGCAGACCTTATTGGTGAAGTTCATTATGTTACTTTGTTCTATT
GGAGACACAAAGTATTGTCCGCCCTAAAACAAATGGATTTCAACGCAATTTCAGGGATTGTAGAGATGGATGAAACATATTTTTTGTACTCTGAAAAGGG
GAAAAGAAACATTGAAGGTCGTAAACCTCGAAAACGTGGGGGTTCTTCAAAGTTTCGGGGCATTAGTCACGAACAAATTTGTGTTTTAATCGCAAGAGAT
CGCCAAAAAGCAACGTTTTCAGGTGTACTTGGTAGAGGTCGAATTGTGAAAACTCAATTAGATAAGGCTATCGGTTCTAAATTATCATTAGGTAATATCC
TATGTACCGATGCTTGGAGGGCTTTTTCTACGTATGCAAAAAGCAAAGGATTGGAGCATTACCGTTTTAAGTCAGATGGAACAGAACGAGTAAAAGGGCT
TTATCATATCCAAAATGTAAATAACTATCACAGCCGTCTAAAAGGCTGGATGCAACGATTTAATGGCGTGGCTACAAAATACCTCGACCATTATTTGAGT
TGGTTTCAATTCTTAGATATTGTTAAACACCAAAGTGACAATGTATCTATTAGCAAAATGATTGTCGAAAGTTGCTTATTCTCAATTAATACAACCTACG
ATAGTCTTAGAACATCACTTTATACCGATTGTTATGAGGGGGAATAAAATGAAAAGTTCTGATTCTCAGTTAAAAAGTCGTGGGAAGATTACAAGCAAAG
ATTTACAACAATATAGCAATCATACACAAATTGAACTATTTGAAATGCTTAAATCCAAAGAAGCATTTAAAAGAACTATCGCTGTGAATATATTATCAGA
GAAATATGATTTGACCGATGACTTGATTCGTTTGTTTCTTCATACTCTTAAACAAGAGAAAAAACTCTATACAAAGATTGAATTATGTGACGCACTTTCA
AAAGGCAATGTCCAGTCTGCAAAGATTATGGTCGAATATTTAGGACAGATAGGCAATAATCAACATATAGTATTACCTACTAATGGTTTCAATAAGAAAA
GTTATCCTCTACCGAGGGATATTATTGCTCGAACTTTAGCTCATATGAAAGAAGAGATTATACCAGTTTTAATGGATGTACTAAAGACAAATAACATTCC
TGCAATTAGGGAAGCTATTGATGCAATAGGTTTCATTTGTTTCTATAACAAAATACATTCTAATACTCAAATTATTGATGCACTTATTCTGTGTTTAGGG
AACAATTTCAACGATAACATTATCCGATGGAAATTGGTCAGAGCATTTGAAAGTTTTAACGACATCAATGTCATTAAAACTCTTGTGGAAATAGAACAAA
ACGATAGTCAATTGGTTATAAGAAATGAAGCCAAGAGGTCACTGAAAATTATTAATAACCGTACTAATAGTTAAAAATGACTTATTAAGAGAATAAGTCA
TTTTTATCGAAAATATCAACATTATAATTTAACAAAGCC
GAATTAATAGCAGAGATAAAAAAATTAAATTCAGCAGAACAACATAGATTAAAAGAATTTTTTATCAGTTCACTTGCGTCATTTTCAGCAAGTGAACCTG
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CGGTCTTAAGGAGATTGAACGCCAACGATACCGCTGTAAATATTGCCGAAAAACTTTTACAGATGTAACCTCGACACCCCTTTACCGTACTCATAAACCT
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TTTTTATCGAAAATATCAACATTATAATTTAACAAAGCC
Protein section
ORF number : 2
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1059 bp | 352 aa | 89 | 1147 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MTLRELIAEIKKLNSAEQHRLKEFFISSLASFSASEPVFQEVTERKNKDGYTCVSCGSKQVVRFGKYMVKLGLKEIERQRYRCKYCRKTFTDVTSTPLYR
THKPDKWLDFIKCMLEGYSLRKSADLIGEVHYVTLFYWRHKVLSALKQMDFNAISGIVEMDETYFLYSEKGKRNIEGRKPRKRGGSSKFRGISHEQICVL
IARDRQKATFSGVLGRGRIVKTQLDKAIGSKLSLGNILCTDAWRAFSTYAKSKGLEHYRFKSDGTERVKGLYHIQNVNNYHSRLKGWMQRFNGVATKYLD
HYLSWFQFLDIVKHQSDNVSISKMIVESCLFSINTTYDSLRTSLYTDCYEGE
THKPDKWLDFIKCMLEGYSLRKSADLIGEVHYVTLFYWRHKVLSALKQMDFNAISGIVEMDETYFLYSEKGKRNIEGRKPRKRGGSSKFRGISHEQICVL
IARDRQKATFSGVLGRGRIVKTQLDKAIGSKLSLGNILCTDAWRAFSTYAKSKGLEHYRFKSDGTERVKGLYHIQNVNNYHSRLKGWMQRFNGVATKYLD
HYLSWFQFLDIVKHQSDNVSISKMIVESCLFSINTTYDSLRTSLYTDCYEGE
Blast result :ORF 2
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
726 bp | 241 aa | 1149 | 1874 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MKSSDSQLKSRGKITSKDLQQYSNHTQIELFEMLKSKEAFKRTIAVNILSEKYDLTDDLIRLFLHTLKQEKKLYTKIELCDALSKGNVQSAKIMVEYLGQ
IGNNQHIVLPTNGFNKKSYPLPRDIIARTLAHMKEEIIPVLMDVLKTNNIPAIREAIDAIGFICFYNKIHSNTQIIDALILCLGNNFNDNIIRWKLVRAF
ESFNDINVIKTLVEIEQNDSQLVIRNEAKRSLKIINNRTNS
IGNNQHIVLPTNGFNKKSYPLPRDIIARTLAHMKEEIIPVLMDVLKTNNIPAIREAIDAIGFICFYNKIHSNTQIIDALILCLGNNFNDNIIRWKLVRAF
ESFNDINVIKTLVEIEQNDSQLVIRNEAKRSLKIINNRTNS
Blast result :Comments : ISBce20 is 78% aa similar to ISBse1.
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