ISBce20

  • Family IS1595
  • Group ISPna2
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
LJKE01000041.1 ND Bacillus cereus
Bacillus cereus
Bacillus cereus B4088
DNA section
IS Length : 1939 bp

Ends


IR Length : 24/29

IRL : GGCTATGTTAAATaactctgttgatatttgattaaaccaaactaatgttc
IRR : GGCTTTGTTAAATtataatgttgatattttcgataaaaatgacttattct

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
ACTATGTTATTTtaaatgttAAAAATGAAGGAG8

DNA sequence

GGCTATGTTAAATAACTCTGTTGATATTTGATTAAACCAAACTAATGTTCTACAATAAATGGACGAACATTAGTTTTGAGGGCTTTAAATGACGTTAAGG
GAATTAATAGCAGAGATAAAAAAATTAAATTCAGCAGAACAACATAGATTAAAAGAATTTTTTATCAGTTCACTTGCGTCATTTTCAGCAAGTGAACCTG
TATTTCAAGAAGTAACTGAACGAAAAAATAAAGATGGCTATACTTGTGTGAGTTGTGGCTCTAAACAAGTTGTGCGTTTCGGTAAGTATATGGTAAAACT
CGGTCTTAAGGAGATTGAACGCCAACGATACCGCTGTAAATATTGCCGAAAAACTTTTACAGATGTAACCTCGACACCCCTTTACCGTACTCATAAACCT
GATAAATGGTTGGATTTTATTAAATGTATGTTGGAAGGCTATTCTCTTCGTAAATCAGCAGACCTTATTGGTGAAGTTCATTATGTTACTTTGTTCTATT
GGAGACACAAAGTATTGTCCGCCCTAAAACAAATGGATTTCAACGCAATTTCAGGGATTGTAGAGATGGATGAAACATATTTTTTGTACTCTGAAAAGGG
GAAAAGAAACATTGAAGGTCGTAAACCTCGAAAACGTGGGGGTTCTTCAAAGTTTCGGGGCATTAGTCACGAACAAATTTGTGTTTTAATCGCAAGAGAT
CGCCAAAAAGCAACGTTTTCAGGTGTACTTGGTAGAGGTCGAATTGTGAAAACTCAATTAGATAAGGCTATCGGTTCTAAATTATCATTAGGTAATATCC
TATGTACCGATGCTTGGAGGGCTTTTTCTACGTATGCAAAAAGCAAAGGATTGGAGCATTACCGTTTTAAGTCAGATGGAACAGAACGAGTAAAAGGGCT
TTATCATATCCAAAATGTAAATAACTATCACAGCCGTCTAAAAGGCTGGATGCAACGATTTAATGGCGTGGCTACAAAATACCTCGACCATTATTTGAGT
TGGTTTCAATTCTTAGATATTGTTAAACACCAAAGTGACAATGTATCTATTAGCAAAATGATTGTCGAAAGTTGCTTATTCTCAATTAATACAACCTACG
ATAGTCTTAGAACATCACTTTATACCGATTGTTATGAGGGGGAATAAAATGAAAAGTTCTGATTCTCAGTTAAAAAGTCGTGGGAAGATTACAAGCAAAG
ATTTACAACAATATAGCAATCATACACAAATTGAACTATTTGAAATGCTTAAATCCAAAGAAGCATTTAAAAGAACTATCGCTGTGAATATATTATCAGA
GAAATATGATTTGACCGATGACTTGATTCGTTTGTTTCTTCATACTCTTAAACAAGAGAAAAAACTCTATACAAAGATTGAATTATGTGACGCACTTTCA
AAAGGCAATGTCCAGTCTGCAAAGATTATGGTCGAATATTTAGGACAGATAGGCAATAATCAACATATAGTATTACCTACTAATGGTTTCAATAAGAAAA
GTTATCCTCTACCGAGGGATATTATTGCTCGAACTTTAGCTCATATGAAAGAAGAGATTATACCAGTTTTAATGGATGTACTAAAGACAAATAACATTCC
TGCAATTAGGGAAGCTATTGATGCAATAGGTTTCATTTGTTTCTATAACAAAATACATTCTAATACTCAAATTATTGATGCACTTATTCTGTGTTTAGGG
AACAATTTCAACGATAACATTATCCGATGGAAATTGGTCAGAGCATTTGAAAGTTTTAACGACATCAATGTCATTAAAACTCTTGTGGAAATAGAACAAA
ACGATAGTCAATTGGTTATAAGAAATGAAGCCAAGAGGTCACTGAAAATTATTAATAACCGTACTAATAGTTAAAAATGACTTATTAAGAGAATAAGTCA
TTTTTATCGAAAATATCAACATTATAATTTAACAAAGCC
Protein section
ORF number : 2

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
1059 bp352 aa891147+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MTLRELIAEIKKLNSAEQHRLKEFFISSLASFSASEPVFQEVTERKNKDGYTCVSCGSKQVVRFGKYMVKLGLKEIERQRYRCKYCRKTFTDVTSTPLYR
THKPDKWLDFIKCMLEGYSLRKSADLIGEVHYVTLFYWRHKVLSALKQMDFNAISGIVEMDETYFLYSEKGKRNIEGRKPRKRGGSSKFRGISHEQICVL
IARDRQKATFSGVLGRGRIVKTQLDKAIGSKLSLGNILCTDAWRAFSTYAKSKGLEHYRFKSDGTERVKGLYHIQNVNNYHSRLKGWMQRFNGVATKYLD
HYLSWFQFLDIVKHQSDNVSISKMIVESCLFSINTTYDSLRTSLYTDCYEGE

 

Blast result :
ORF 2
LengthBeginEndStrandFusion ORF
726 bp241 aa11491874+No
ORF function : Passenger Gene
Annotation : Hypothetical proteinDescription :

ORF sequence :

MKSSDSQLKSRGKITSKDLQQYSNHTQIELFEMLKSKEAFKRTIAVNILSEKYDLTDDLIRLFLHTLKQEKKLYTKIELCDALSKGNVQSAKIMVEYLGQ
IGNNQHIVLPTNGFNKKSYPLPRDIIARTLAHMKEEIIPVLMDVLKTNNIPAIREAIDAIGFICFYNKIHSNTQIIDALILCLGNNFNDNIIRWKLVRAF
ESFNDINVIKTLVEIEQNDSQLVIRNEAKRSLKIINNRTNS

 

Blast result :Comments : ISBce20 is 78% aa similar to ISBse1.
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References