ISSpn3
- Family ISL3
- Group
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
HG965092 | ND | Streptococcus pneumoniae | Streptococcus pneumoniae 11A |
DNA section
IS Length : 1479 bp
Ends
IR Length : 17/27
IRL : GGTTCTATAATTTTTAGGGTTGATGGAATTTTTCCACCAACCCTATTTTG
IRR : GGCTCTTTGTCAAATAGTGTTGATGAAGAATTTTAGGAAGGGATTAAGCA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
TACCCCGTAA | CAATTTGATA | 0 |
DNA sequence
GGTTCTATAATTTTTAGGGTTGATGGAATTTTTCCACCAACCCTATTTTGTGTATACAAAAAGGCCAACATCCATTATATTAAAAGCGCTGAAACCTAAA
ACAAAAGGATGATGCCCATATGCACAATATACTAGAAGCTACACCACAAATCAAAGATAAACACATGATTTGGGATAATAAAGTTCAAGAGAAGGTATTT
AAAAAGAGAATATCTTTATTTTATTCAGCTACATATACGCATAACCCAGAATTGTGCACTGTTTGTGGATGTGTTAGCCAAAATAATAATATCGTTAAAA
ACGGCACGAAAACATCTCGTATCACTCTCTGTTCTGTTTCAGGCCTTCCGGCCTACTTAAATCTACGCAAGCAGAGATTTCTCTGTAGAGAATGCGGCTC
TTCATTTACCGCAGACACTAGTCGAATCGTAGAAAAACACTGTCATATCTCTAAAAGATTAAAAAATGAAATCAAATCAAAAATTAGTGAAACAGTATCT
GAAACATATATCGCAAAAGAAACAAATGTTTCAGTTCATACTGTAAGACGTATCATAGATGATACAGCACGATTATTGACCATTAAACCATTACACGATT
TACCTGAGCATTTGTGTTTTGATGAATTTAAATCCGTTAAATCTTCCGATAGTAATATGAGCTTCATTATTTGTGATAGCACTACACACAAGCTGGTCGA
TGTTGTACGAGATAGAAAATCTTACAGTTTGAAACAATATTTTTATCGTTTTGAGCCTAAGACTAGATTAAAGGTAAAAACCATCTCTATCGACATGTAC
GTACCGTACATTCAATTAATAAAAGAAATGTTTCCTAACGCTAAAATTATCATTGATCCTTTTCACATCGTACAAGCCTTAAATAGAGAATTAAATCGAA
CTCGGGTACGTGTCATGAATCAGCATCGTTATAAAGACGCTAAATTATATCGAAAGTTAAAACATTATTGGAAGTTAATTTTAAAGAATCCTAATGAACT
TCAGAACTATAAATATAATCGTTATAAGCTTTTTGAAAGCTTTATGACAACCCAAGGAATTGTGGATTATATCTTAGAAAACAATCCATCTCTTAAACAT
GATTATGAGGTTGTACATTCACTTCGTGAATGTATACAGGATAGAGATTATATAGAATTCAAGGAAACGATTGAAGCAGCTACGCAATTAGACCTATCTC
CTGGGTTAAAAAGAGTATTAAAGACTCTTATGACTTACTTGCCATATATTCAAAATACTTGTGAGTATCCAACTAGAACAAATGGCCCTATCGAAGGAAT
AAACAATAAAATAAAAGTGCTTAAAAGAAATGCCTACGGTTTTAAAAACTATTACCATTTTAGAAACAGGATTATCTTAATAACAAAAATGTTTGGCCCA
AAACAAAAAGGAATTAAGCAACAATTAGTTGCTTAATCCCTTCCTAAAATTCTTCATCAACACTATTTGACAAAGAGCC
ACAAAAGGATGATGCCCATATGCACAATATACTAGAAGCTACACCACAAATCAAAGATAAACACATGATTTGGGATAATAAAGTTCAAGAGAAGGTATTT
AAAAAGAGAATATCTTTATTTTATTCAGCTACATATACGCATAACCCAGAATTGTGCACTGTTTGTGGATGTGTTAGCCAAAATAATAATATCGTTAAAA
ACGGCACGAAAACATCTCGTATCACTCTCTGTTCTGTTTCAGGCCTTCCGGCCTACTTAAATCTACGCAAGCAGAGATTTCTCTGTAGAGAATGCGGCTC
TTCATTTACCGCAGACACTAGTCGAATCGTAGAAAAACACTGTCATATCTCTAAAAGATTAAAAAATGAAATCAAATCAAAAATTAGTGAAACAGTATCT
GAAACATATATCGCAAAAGAAACAAATGTTTCAGTTCATACTGTAAGACGTATCATAGATGATACAGCACGATTATTGACCATTAAACCATTACACGATT
TACCTGAGCATTTGTGTTTTGATGAATTTAAATCCGTTAAATCTTCCGATAGTAATATGAGCTTCATTATTTGTGATAGCACTACACACAAGCTGGTCGA
TGTTGTACGAGATAGAAAATCTTACAGTTTGAAACAATATTTTTATCGTTTTGAGCCTAAGACTAGATTAAAGGTAAAAACCATCTCTATCGACATGTAC
GTACCGTACATTCAATTAATAAAAGAAATGTTTCCTAACGCTAAAATTATCATTGATCCTTTTCACATCGTACAAGCCTTAAATAGAGAATTAAATCGAA
CTCGGGTACGTGTCATGAATCAGCATCGTTATAAAGACGCTAAATTATATCGAAAGTTAAAACATTATTGGAAGTTAATTTTAAAGAATCCTAATGAACT
TCAGAACTATAAATATAATCGTTATAAGCTTTTTGAAAGCTTTATGACAACCCAAGGAATTGTGGATTATATCTTAGAAAACAATCCATCTCTTAAACAT
GATTATGAGGTTGTACATTCACTTCGTGAATGTATACAGGATAGAGATTATATAGAATTCAAGGAAACGATTGAAGCAGCTACGCAATTAGACCTATCTC
CTGGGTTAAAAAGAGTATTAAAGACTCTTATGACTTACTTGCCATATATTCAAAATACTTGTGAGTATCCAACTAGAACAAATGGCCCTATCGAAGGAAT
AAACAATAAAATAAAAGTGCTTAAAAGAAATGCCTACGGTTTTAAAAACTATTACCATTTTAGAAACAGGATTATCTTAATAACAAAAATGTTTGGCCCA
AAACAAAAAGGAATTAAGCAACAATTAGTTGCTTAATCCCTTCCTAAAATTCTTCATCAACACTATTTGACAAAGAGCC
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1317 bp | 438 aa | 120 | 1436 | + | No |
Chemistry : Unknow
ORF sequence :
MHNILEATPQIKDKHMIWDNKVQEKVFKKRISLFYSATYTHNPELCTVCGCVSQNNNIVKNGTKTSRITLCSVSGLPAYLNLRKQRFLCRECGSSFTADT
SRIVEKHCHISKRLKNEIKSKISETVSETYIAKETNVSVHTVRRIIDDTARLLTIKPLHDLPEHLCFDEFKSVKSSDSNMSFIICDSTTHKLVDVVRDRK
SYSLKQYFYRFEPKTRLKVKTISIDMYVPYIQLIKEMFPNAKIIIDPFHIVQALNRELNRTRVRVMNQHRYKDAKLYRKLKHYWKLILKNPNELQNYKYN
RYKLFESFMTTQGIVDYILENNPSLKHDYEVVHSLRECIQDRDYIEFKETIEAATQLDLSPGLKRVLKTLMTYLPYIQNTCEYPTRTNGPIEGINNKIKV
LKRNAYGFKNYYHFRNRIILITKMFGPKQKGIKQQLVA
SRIVEKHCHISKRLKNEIKSKISETVSETYIAKETNVSVHTVRRIIDDTARLLTIKPLHDLPEHLCFDEFKSVKSSDSNMSFIICDSTTHKLVDVVRDRK
SYSLKQYFYRFEPKTRLKVKTISIDMYVPYIQLIKEMFPNAKIIIDPFHIVQALNRELNRTRVRVMNQHRYKDAKLYRKLKHYWKLILKNPNELQNYKYN
RYKLFESFMTTQGIVDYILENNPSLKHDYEVVHSLRECIQDRDYIEFKETIEAATQLDLSPGLKRVLKTLMTYLPYIQNTCEYPTRTNGPIEGINNKIKV
LKRNAYGFKNYYHFRNRIILITKMFGPKQKGIKQQLVA
Blast result :
Comments
ISSpn3 is 88% aa similar to ISSau8.
References
1] Mingoia,M., Morici,E., Morroni,G., Giovanetti,E., Del Grosso,M., Pantosti,A. and Varaldo,P.E. (2014) Antimicrob. Agents Chemother. 58 (10), 5886-5893.