ISWosp7
- Family IS4
- Group IS231
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
ND | Wolbachia sp. | Wolbachia sp. |
DNA section
IS Length : 1448 bp
Ends
IR Length : 23/26
IRL : CATACGCGTCAAGTTAAGGAACTGTGGTAATAAACTTAGTGTAAGGAAGA
IRR : CATACGCGTCAAGTTAAGAGATTGTGAGCAAATTTAGAGAAGTTAAGGTG
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
GTTTGACACA | TTTGTTTAA | ACTCCCTATC | 9 |
DNA sequence
CATACGCGTCAAGTTAAGGAACTGTGGTAATAAACTTAGTGTAAGGAAGAGAAAAAAAAGATATAAGTTCTCTTAAATCTAACAAAGAAAACGGAGAACT
TATACAATGAAAAGAATAGTTTGCATCTCAAAAAAGCTCAAAGAATTTTTTAATGAAAAAGCAGATAAAATCTCAGCTACAACAGGGTTCATAAAAAGAA
AGAGGAAGCTAAAAGGCTCGTCGTTCATAAAAGCCATCGTTTTGGGTAATATAGGGGTTGATAATTGTAGTATAGAGACAGTGTGTCAATTATTGAATGA
AGACTCGATAAATATAACAAAACAAGGTCTGGACTTTAGATTTACCAAGGAAGCAGTGGAATTTATGAAAAGAATGTATAATGAATCTTTAACGTTACTT
AAAAATACCTTACAAGTTGATTGCAGAATCTTGAAGCACTTTGGAGGTGTTAAATTATTAGACAGCAGCTACATTAGCTTACCTAACAGTATGGAAGACA
TGTATAAAGGTTATGGTACCAGCTACAGTGGTTATGAAAGCAATACTAAGTCTAGAATAAAGTTACAATTAGTTTTTGACTACCTAAACCAGACATTAGA
CCAGCTTAATATAACTGAAGGAATAAGGTCAGATCAGGGTTATAGAAGCCATTTAAGCAATATATCGAACAACGATTTACTAATATCTGATTTGGGTTAT
TCTGTGCCAAGTTCTTTTAAACAAATCAATGAAATAGGAGCTTATTTCATAAGTCGTTATAAATCCGATATTAACATATATGATATAGAGACAGGTCAAA
AAATAGATTTACTAGAACATTTGGGAGATCGATCTTTTCTAGAACAGGAGGTATTGTTAGGAAAAGAGACAAGGGTTAAAGTAAGAATTATATTTAAAAA
ACTAACTGAAGAACAAGCTATGGCTAGAAGAAGAAAGGCTAATAGGTTAGCAAGATCACATGGATACACATCTTCTCAAAGGAACCAAAAGTTACTAAAT
TGGTCGATATTTATAACTAATGTTCCAAAAAGTAAGATTAATGCTGAGCAAATACTAGTAGTTTACCGAATAAGATGGCAAATTGAATTATTGTTCAAAT
TATATAAGAGTAATATAAGGCTTGATAAGCTGAGAGGAATGCCATACAGAGTATTATGTGAGCTATATGCCAAATTGTGTGCAATTCTTATATTTCATGG
AGTAGTGGGTTGCACAGAACTGAAAAAAAATACGGAGCTTAGCTTAACAAAGGCATTTATTGAGCTAAAAAGACGGGTTAGAGAGTTATTTTTAGCACTA
AATAATAAAACTAAAGGCTTAAATATTTTTCTCAAAAAGCTTACCATAACTTGGTCGCAGTTTTCATTAAAAGACAAGTACAGAGAAACTAGGGTATCCA
CCTTAACTTCTCTAAATTTGCTCACAATCTCTTAACTTGACGCGTATG
TATACAATGAAAAGAATAGTTTGCATCTCAAAAAAGCTCAAAGAATTTTTTAATGAAAAAGCAGATAAAATCTCAGCTACAACAGGGTTCATAAAAAGAA
AGAGGAAGCTAAAAGGCTCGTCGTTCATAAAAGCCATCGTTTTGGGTAATATAGGGGTTGATAATTGTAGTATAGAGACAGTGTGTCAATTATTGAATGA
AGACTCGATAAATATAACAAAACAAGGTCTGGACTTTAGATTTACCAAGGAAGCAGTGGAATTTATGAAAAGAATGTATAATGAATCTTTAACGTTACTT
AAAAATACCTTACAAGTTGATTGCAGAATCTTGAAGCACTTTGGAGGTGTTAAATTATTAGACAGCAGCTACATTAGCTTACCTAACAGTATGGAAGACA
TGTATAAAGGTTATGGTACCAGCTACAGTGGTTATGAAAGCAATACTAAGTCTAGAATAAAGTTACAATTAGTTTTTGACTACCTAAACCAGACATTAGA
CCAGCTTAATATAACTGAAGGAATAAGGTCAGATCAGGGTTATAGAAGCCATTTAAGCAATATATCGAACAACGATTTACTAATATCTGATTTGGGTTAT
TCTGTGCCAAGTTCTTTTAAACAAATCAATGAAATAGGAGCTTATTTCATAAGTCGTTATAAATCCGATATTAACATATATGATATAGAGACAGGTCAAA
AAATAGATTTACTAGAACATTTGGGAGATCGATCTTTTCTAGAACAGGAGGTATTGTTAGGAAAAGAGACAAGGGTTAAAGTAAGAATTATATTTAAAAA
ACTAACTGAAGAACAAGCTATGGCTAGAAGAAGAAAGGCTAATAGGTTAGCAAGATCACATGGATACACATCTTCTCAAAGGAACCAAAAGTTACTAAAT
TGGTCGATATTTATAACTAATGTTCCAAAAAGTAAGATTAATGCTGAGCAAATACTAGTAGTTTACCGAATAAGATGGCAAATTGAATTATTGTTCAAAT
TATATAAGAGTAATATAAGGCTTGATAAGCTGAGAGGAATGCCATACAGAGTATTATGTGAGCTATATGCCAAATTGTGTGCAATTCTTATATTTCATGG
AGTAGTGGGTTGCACAGAACTGAAAAAAAATACGGAGCTTAGCTTAACAAAGGCATTTATTGAGCTAAAAAGACGGGTTAGAGAGTTATTTTTAGCACTA
AATAATAAAACTAAAGGCTTAAATATTTTTCTCAAAAAGCTTACCATAACTTGGTCGCAGTTTTCATTAAAAGACAAGTACAGAGAAACTAGGGTATCCA
CCTTAACTTCTCTAAATTTGCTCACAATCTCTTAACTTGACGCGTATG
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1329 bp | 442 aa | 107 | 1435 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MKRIVCISKKLKEFFNEKADKISATTGFIKRKRKLKGSSFIKAIVLGNIGVDNCSIETVCQLLNEDSINITKQGLDFRFTKEAVEFMKRMYNESLTLLKN
TLQVDCRILKHFGGVKLLDSSYISLPNSMEDMYKGYGTSYSGYESNTKSRIKLQLVFDYLNQTLDQLNITEGIRSDQGYRSHLSNISNNDLLISDLGYSV
PSSFKQINEIGAYFISRYKSDINIYDIETGQKIDLLEHLGDRSFLEQEVLLGKETRVKVRIIFKKLTEEQAMARRRKANRLARSHGYTSSQRNQKLLNWS
IFITNVPKSKINAEQILVVYRIRWQIELLFKLYKSNIRLDKLRGMPYRVLCELYAKLCAILIFHGVVGCTELKKNTELSLTKAFIELKRRVRELFLALNN
KTKGLNIFLKKLTITWSQFSLKDKYRETRVSTLTSLNLLTIS
TLQVDCRILKHFGGVKLLDSSYISLPNSMEDMYKGYGTSYSGYESNTKSRIKLQLVFDYLNQTLDQLNITEGIRSDQGYRSHLSNISNNDLLISDLGYSV
PSSFKQINEIGAYFISRYKSDINIYDIETGQKIDLLEHLGDRSFLEQEVLLGKETRVKVRIIFKKLTEEQAMARRRKANRLARSHGYTSSQRNQKLLNWS
IFITNVPKSKINAEQILVVYRIRWQIELLFKLYKSNIRLDKLRGMPYRVLCELYAKLCAILIFHGVVGCTELKKNTELSLTKAFIELKRRVRELFLALNN
KTKGLNIFLKKLTITWSQFSLKDKYRETRVSTLTSLNLLTIS
Blast result :
Comments
ISWosp7 is 92% aa similar to ISWen1.
References
1] Mingxing Jiang (2012) Direct submission to ISfinder