ISWosp8
- Family IS4
- Group IS4
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
ND | Wolbachia sp. | Wolbachia sp. |
DNA section
IS Length : 1462 bp
Ends
IR Length : 17
IRL : ATACGCGTCAAGTTAAGGAAAAATGTCAGTGATTGTGTATAAAATTTCTC
IRR : ATACGCGTCAAGTTAAGAGCCTCAATTAACAAACTCTCCTAAAGACATGA
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|
DNA sequence
ATACGCGTCAAGTTAAGGAAAAATGTCAGTGATTGTGTATAAAATTTCTCACTAAAATTTTTACCATTAAATTATCCAAAAGCTGCAATAAACAGCACTA
TTGCTTCTATTTTATTTCAACAAAAGAGTCTAAAATGTGTCCTTTTTAGGTGAAACATGCAAAAAGGAAAAAATCTTATTCTACAAATTAAAAATATAAT
ATACTCGAAAACTTTTCAGAGAATTCATTGTGTTGGAAAAAACAGTTTCACGCGAACAAGAAAACTCCCTTTTACGACAGTATTTTCTATGATTTTAAAG
TTAGTAAAAAAAAGTTTGGGAATAGAATGTGAACTTATGGATCCATTGACTTGTAAAGTTCCGCCATCAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAGGTATAAGA
TTTGTCACACAGGTTTTAAAGAATTGTTGGAGCTAAGCATCCAAACAGCCTATCAAGATGAACCTGAGTATGGAACCTGGAGAGGCTATAGACTTATTGC
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GCAAGAGTTTTTTTGTTTGTTGATTTGTGTACTTCGCTGATTTGCAGTGCTCGTATTGCGGCTTGGAATATAGGAGAACAAACGTTGGCGGAAGAGCAAT
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GAAAACGAAAAGCTAAAAAGTAAAATGAAAGGACAGAAAGTAAGAGTTATAGTGCTGACATTAGCCAACGGAGAAACAGAGGTATTGGTTACTTCACTTT
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GGGCCTTGGAACCCAGATCAAATTGCTGAGTATCGTTTAAATTTTTCAGTTTTATTTGGTGTAATGAGACAGAAACTCTATCAAGTACTTATTGGAATTT
GTTCACCAAAAAGCTTTCAAACCCTTTTTGATAGAGCAAGTATACGCGCTAAAGTGAAAATTCGACCAGGGCGATTGTATAGCCGCAATAAGGTAGATAA
GCCCAAACGCCATCATGTCTTTAGGAGAGTTTGTTAATTGAGGCTCTTAACTTGACGCGTAT
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GCCCAAACGCCATCATGTCTTTAGGAGAGTTTGTTAATTGAGGCTCTTAACTTGACGCGTAT
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1281 bp | 426 aa | 157 | 1437 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MQKGKNLILQIKNIIYSKTFQRIHCVGKNSFTRTRKLPFTTVFSMILKLVKKSLGIECELMDPLTCKVPPSKQAFSKARYKICHTGFKELLELSIQTAYQ
DEPEYGTWRGYRLIAADGSGMRLPSSEEIVSKFGRFKPNGTTGTMPPLARVFLFVDLCTSLICSARIAAWNIGEQTLAEEQLSEVVTQMRSLNQERLLFI
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KIRPGRLYSRNKVDKPKRHHVFRRVC
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KIRPGRLYSRNKVDKPKRHHVFRRVC
Blast result :
Comments
ISWosp8 is 44% aa similar to ISHch2.
References
1] Mingxing Jiang (2012) Direct submission to ISfinder