ISWosp5
- Family IS4
- Group IS231
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
ND | Wolbachia sp. | Wolbachia sp. |
DNA section
IS Length : 1435 bp
Ends
IR Length : 18
IRL : CATACGCGTCAAGTTAAGGAAATAAAGGTATGAAAGAGATAGAATAATAA
IRR : CATACGCGTCAAGTTAAGAAGCAAGTGTTAGAAAGTTCAATGAGCTTAGT
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
CTGGCCACAG | TAAGGAAAA | CAGTGCAGAT | 9 |
DNA sequence
CATACGCGTCAAGTTAAGGAAATAAAGGTATGAAAGAGATAGAATAATAAGGTATAAGTTCTCCCAGATATACTTTTAGTGAGAGAACCAATGAATAAAA
TAACTTGCTTATCAAAAAAGCTCAAAGAATTTTTTAATGAAAAAGCAGATAAAATCTCAATTAGAACAGGGTTCATAAAAAGAAAGAGAAAGCTAAGAGG
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ATTTGAGAATCTTCCTAAAAAAGCTTACCACAGACTGGTCACAATTTTCTGTGAAAGACAGGTATAGAAAAATTAGAGTCTCCACACTAAGCTCATTGAA
CTTTCTAACACTTGCTTCTTAACTTGACGCGTATG
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1344 bp | 447 aa | 79 | 1422 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
VREPMNKITCLSKKLKEFFNEKADKISIRTGFIKRKRKLRGSSFIKAMVLGNIGVDNCSIETMCQLLNEDSIEMTKQGLDFRFTEEAVEFMKRMYNESLM
LFKGILQINCRILKQFRSVKLLDSSYISLPNSMENMYKGYGTSYSGYESNTKSRIKLQLVFDYLNQTLTQLNITEGIRSDQGYRRYLSSISNNDLLISDL
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Blast result :
Comments
ISWosp5 is 95% aa similar to ISWen1.
References
1] Jiang M. (2010) Direct submission GenBank.