ISBun2
- Family IS1595
- Group ISNwi1
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
NZ_AAYH02000036 | ND | Bacteroides uniformis | Bacteroides uniformis ATCC 8492 |
DNA section
IS Length : 4739 bp
Ends
IR Length : 25/27
IRL : CCCAATTATATACTTTAATGTACTAATTTTAATTCTATCTATTTATATCT
IRR : CCCAATTATATACTTTAATGCACCAATCACACAAAAATAAAAGCCGCACC
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
ATGCCAAGAATA | TCTCTTTA | TTGGCATTGCTGG | 8 |
DNA sequence
CCCAATTATATACTTTAATGTACTAATTTTAATTCTATCTATTTATATCTTATTTCAATGGGGAAATCTTTTAGGTTTCCCTATTTTTTATGCCCGTTTT
CAAGTGAATCAAAACGTTAGTTCTGTTAAACTTTGTTTCTAATATCATAGATAATAGTCGAAATTCGATAAAAAAATCGGTTTTCAGTATCAGAAAACCG
ATTTATAAAGGTTAAATAATGCTCCTTTATGTAAATCAGCCAAATTTGGTAAAAAGCGGTAAATAAATACTGTAATCTCCTCAAATGGAGAGATTATAAT
TATGAAAAAATTAAAAGAATTGATTAGAACGCTTCACAGCGTTTTATGTTTTACAGTAAAAATCTACCAAATATTATACCGCATTTGGCTGATTAAGTCC
TTAATCGAATTGATTAAGGGAGATTGGTAAATTTGCATTAAGAACTTGATTGTTTACGGCAGTCAAGTTCTGTTTTTAACCGTGTTTTCAAGTGAATCAA
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TTTTTAATCACTTATGTTTTATATGTTAGGATTTTTTATTATATTTATATAATAAAAATAACATGTCAATTGGAAACAGAAATAATCAATATTGTAGAAA
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AAACGATGTAAGAAAAGATTTACGGTTACTATTGGTACAATGTTTGAAGGTAGTCATGTGTCATTAAAGAAATGGTTCTATGCATTGTATATATTCTTAG
CCCATAAGAAAGGAATAAGTAGCATACAATTATCTAAGGATATAGATGTAACACAGAAAACAGCTTGGTTTATGTTGGAACGGATAAGACATAATTTGAA
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CTTAAAGTAAAGACTCCCGTAGTAGGTCTATTATCTAATGGAATGGCCTATACAGCCGTTGTTCCAAATACCGGTGGAAAGGTTTTGAAAACGATAATCA
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TGGTGAATATGTAAAAGACGGATTCCATACCAATAGTATTGAAGGATTTTGGTCACACTTGAAACGTGGAATATTAGGAATATATCATAAAGTAAGTCCA
AAGCATTTGGATAAATACTGTGATGAATTTGCATTTAGATATAATACGAGAGGACTAACAGATGTTGAAAGATTTACTTATTTTACGATGTCAGCATATA
AAAGATTAAAGTATCAAAGTTTGATTTCCCCATAAGAATAGGTAAATTTGAATTGAAAATAGAAAAAGAGCAGTTCACGAAGTAGCATTTTTGCTAAATA
GTTCCTATATTTGCATTGTCCCAAGAGGGACAGACATAGTTTAGGAAGCGTTTAGCTTATTCCTTGTCAATGAATCTGGACAATTCACCTGCACTGAGGA
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ACAGTCTTCTGCAATGATTGTCATTTGTCGGATGATATTCCAAAGTTAGTTGCTGATGAATTGTTGGGTATTCAGCAATTAGATATGTTAAAGGCTCGTT
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TGTTTGTATTCCCATTTTGAATCCATTGTTTAGAAAAGATTTTACAGATAAAGGTGCAATAGGTTTGGATTTGCCGACTTGGTTTAATGTTCAAGTCGAT
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ATGCAACCCATAGAAAAAGTGGAAGTGGTGGTAAAATGGCAGATTTGTTGATTAATAGTCTGATTAAGAAAGAGTTTGCAATATACCTGACTGATGCGAA
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CCAAATCTTTGTGTTTGTTTAGGTAAGAAAGCGAAAGAGGTTTTAGATAAATGTGTGGTAAATGCCAAATCAATAATGTTGCCGCATTTGTCGGGAACTG
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AAAATAGTAGAATTATGGGTTGTATAACATTCGTATTGTTAGTATTGAATATCATTGCATTAGTTGCAATAGATATTATGTTTTGGGCTGAAAGTGCAGC
TTCGGGACTTGCTGGAGTATTTGGTATTATAGCATTCTTTATAGGATATGCTTTGAGTGTGGAAGTAACGATTGCCCCAAGAGATTTTTGGGTAAATTCT
GCATTCGGTATCTTTATAAAGAAACTTGGTGTAGCCAATATGACAGCTTTTGCAGTGTGGTTTATCGGAAATTTGATAATTGGGTAGAAACATTAAAATG
AGAAGATATGAGCAATAATGAAAATTCAGTTTTAGAGTATTTGAAAGCAAACAATGAAGTATTGTTTGATAAAATCGTGAATGCTTTGCGTAAAGGAAAG
CAAGTTAATTTTACGGATATTAATCAAAGTGATATTATCATTTTGAGTCCGCAGAAAGCATTTGAATATGCGGGAGAAGAAGGCGATAAGTATTTTAAAG
TTTGGATGGTAGGGGGTACTATTGCTTGGTGTACTTGGGCTAATTCAATGGTTGATAGCGATTTCCGTTGGAATGCTAAGGCGAGAAATGAAAACAAAAG
AGATAATAAGGACATTTTGGGTAATGAGCCTTATGTTTCTGCTTATTTGAAGTCTAATTCTGCCATTGAACAATGTTCAGTAGTTTATATGTTCCCGTTT
GAAGCTTTTTCCCAAAAGAAGGTAGAAGTTGTGAAGAAGGTGGAAAAGATAGAGAATACAAATAAAGATGAAAATAAAACAACCGATGTACAAGTAAAAA
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AAAGCAGAAGAATGGGATTATAAAAAAGCTGGACTATTTGGAAAAATAGCTAAAGTGTTGAAGAAATGATTTGAATATAGAGAATTTTGGCAAGACCGTA
TCAAAGTATAAGTATTGAGATACGGTCTTGTTTTATACATATATAAATCATAAATTGAAATACAGATTTATGTGTAAAGAAAGATTCCTAATATCCCCCC
CCCCATTTAGGTAATCAAGTGACGAAATCCACCATTGGTGTACCACCTCGTAAATGTGTTAAACATCTTAAAGGAAATTGTAAAATCCTGAGCAGGAAGG
AGGCACATTATGGCTTGGAATGATTTGGCATCAAATGAGTGTCCTACAAAAGCGGATATAAATGCAAGATTTAAAGAATACTTGAATTGGCAATCACGTA
GTATTACTTTTGATAATTCTGATTATACCGTAAACCCTGGTGGAGCACCTTGGAATTATTTGTTTATATGGATAGAAAATACAATTTCAGAATGGAATAA
TAGAACTCCATATATACCAATACCGTCATGTTTATTAATTCCTAAAGCTGATAATGGTGCTGTTATGACATTTGATATAAAGATTTATGATGTTGAGTTT
ACGTTAAAAAAACTTGAGCTAAAAAATACACTTAAGGTTAGTTTTAATGGTACAACAGGTGATATAAGATTGCAAAAAGAAAATGCTAATATAACTTGTT
ATTTTAACTATATTGTTTTCTGTTAGTATGAATTAATAATATGGATATAATAAATTTTTCTAAAATAGCCGCACCTAAGTTTGAATTTGGGTGCGGCTTT
TATTTTTGTGTGATTGGTGCATTAAAGTATATAATTGGG
CAAGTGAATCAAAACGTTAGTTCTGTTAAACTTTGTTTCTAATATCATAGATAATAGTCGAAATTCGATAAAAAAATCGGTTTTCAGTATCAGAAAACCG
ATTTATAAAGGTTAAATAATGCTCCTTTATGTAAATCAGCCAAATTTGGTAAAAAGCGGTAAATAAATACTGTAATCTCCTCAAATGGAGAGATTATAAT
TATGAAAAAATTAAAAGAATTGATTAGAACGCTTCACAGCGTTTTATGTTTTACAGTAAAAATCTACCAAATATTATACCGCATTTGGCTGATTAAGTCC
TTAATCGAATTGATTAAGGGAGATTGGTAAATTTGCATTAAGAACTTGATTGTTTACGGCAGTCAAGTTCTGTTTTTAACCGTGTTTTCAAGTGAATCAA
AGAATTTTGTTAAAGAATCCTAAGTAGATAACACTTGAGATTGGATTTGGGTATAATTCGCCAAAGTAGTTTTCATGGTAGTAAAAACCAAGTGTTCCAA
GTATCGTACTGGAAGCACTTGGTTAATGATTATAAATGAGCAATAATTACAGGATATATGTATATGATAATTATATCCAATTGTTTATTTAAGTATCTAA
TTTTTAATCACTTATGTTTTATATGTTAGGATTTTTTATTATATTTATATAATAAAAATAACATGTCAATTGGAAACAGAAATAATCAATATTGTAGAAA
TAATAAAGAAGAATAAACAAATGCGAGAAGTAAAGTCATTTATTGATTTGATGAAATCCTTTTATGATGAAAAATCATGCAGAGAATTTCTTGAAGATAT
TAAATGGCGTGGAGAACCGATTTGCCCACACTGTAATTGTCAAACGAAAGAGCATTATAAGTTAAAGTCTAATGGAGAATTTAAAGGACTATATAAATGT
AAACGATGTAAGAAAAGATTTACGGTTACTATTGGTACAATGTTTGAAGGTAGTCATGTGTCATTAAAGAAATGGTTCTATGCATTGTATATATTCTTAG
CCCATAAGAAAGGAATAAGTAGCATACAATTATCTAAGGATATAGATGTAACACAGAAAACAGCTTGGTTTATGTTGGAACGGATAAGACATAATTTGAA
AGACAAGCTTGTAGTTCAATTTAATGATATGACACAAGTTGATGAAACCTATGTCGGTGGTAAGAATAAAGGTAGAGTAAAGAATGCACAAGGAAGAAGC
CTTAAAGTAAAGACTCCCGTAGTAGGTCTATTATCTAATGGAATGGCCTATACAGCCGTTGTTCCAAATACCGGTGGAAAGGTTTTGAAAACGATAATCA
ATACTTTAGTCAAGGAAGGTTCTACCGTTATAACAGATGGATGGAAAGGTTATACTGGAATATCGAAAAATTATATTCATAAAGTAGTTGAACATAGTAC
TGGTGAATATGTAAAAGACGGATTCCATACCAATAGTATTGAAGGATTTTGGTCACACTTGAAACGTGGAATATTAGGAATATATCATAAAGTAAGTCCA
AAGCATTTGGATAAATACTGTGATGAATTTGCATTTAGATATAATACGAGAGGACTAACAGATGTTGAAAGATTTACTTATTTTACGATGTCAGCATATA
AAAGATTAAAGTATCAAAGTTTGATTTCCCCATAAGAATAGGTAAATTTGAATTGAAAATAGAAAAAGAGCAGTTCACGAAGTAGCATTTTTGCTAAATA
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ATAAGCAAATGAGAAAGTGCTATGACTTCTCGTATGCAGAATGGCAAAAAGAGTTTTCCGATGATTTGAAGCCTTTTAATGGATATACAGATACTACCTC
TGTTTGTATTCCCATTTTGAATCCATTGTTTAGAAAAGATTTTACAGATAAAGGTGCAATAGGTTTGGATTTGCCGACTTGGTTTAATGTTCAAGTCGAT
AATGTCCGAATTATGCTTATTGCGCAAGACCCGTTACGTGATGCGAAATGGTATGAAGAATGCCATGATGCGATAGTATCAAGTCCATTTGGGCTGCATG
ATGCAACCCATAGAAAAAGTGGAAGTGGTGGTAAAATGGCAGATTTGTTGATTAATAGTCTGATTAAGAAAGAGTTTGCAATATACCTGACTGATGCGAA
TAAGTATTTTGTACATGATAGAGAAATGTCTAAAACCTGTTTAGAAAGTAAATTAGAGGTATATACTGATATATTGCAAAAAGAATTAGACTTAGTGAGA
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AAAATAGTAGAATTATGGGTTGTATAACATTCGTATTGTTAGTATTGAATATCATTGCATTAGTTGCAATAGATATTATGTTTTGGGCTGAAAGTGCAGC
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GCATTCGGTATCTTTATAAAGAAACTTGGTGTAGCCAATATGACAGCTTTTGCAGTGTGGTTTATCGGAAATTTGATAATTGGGTAGAAACATTAAAATG
AGAAGATATGAGCAATAATGAAAATTCAGTTTTAGAGTATTTGAAAGCAAACAATGAAGTATTGTTTGATAAAATCGTGAATGCTTTGCGTAAAGGAAAG
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AGATAATAAGGACATTTTGGGTAATGAGCCTTATGTTTCTGCTTATTTGAAGTCTAATTCTGCCATTGAACAATGTTCAGTAGTTTATATGTTCCCGTTT
GAAGCTTTTTCCCAAAAGAAGGTAGAAGTTGTGAAGAAGGTGGAAAAGATAGAGAATACAAATAAAGATGAAAATAAAACAACCGATGTACAAGTAAAAA
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TGAAGAAGATTATCGTAGGTGTCGGACTGAATTTGATACTAAATTGATGAGATTGAAATGTCTGGATGAGCACAATAAGATGATACCGTATTTTGAAAAG
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TATTTTTGTGTGATTGGTGCATTAAAGTATATAATTGGG
Protein section
ORF number : 5
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
966 bp | 321 aa | 770 | 1735 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
METEIINIVEIIKKNKQMREVKSFIDLMKSFYDEKSCREFLEDIKWRGEPICPHCNCQTKEHYKLKSNGEFKGLYKCKRCKKRFTVTIGTMFEGSHVSLK
KWFYALYIFLAHKKGISSIQLSKDIDVTQKTAWFMLERIRHNLKDKLVVQFNDMTQVDETYVGGKNKGRVKNAQGRSLKVKTPVVGLLSNGMAYTAVVPN
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TGGKVLKTIINTLVKEGSTVITDGWKGYTGISKNYIHKVVEHSTGEYVKDGFHTNSIEGFWSHLKRGILGIYHKVSPKHLDKYCDEFAFRYNTRGLTDVE
RFTYFTMSAYKRLKYQSLISP
Blast result :ORF 2
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
108 bp | 35 aa | 1944 | 2051 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MLIYSQRRELFSFFGAEVVQNPLTEFDNSLAPSLF
Blast result :ORF 3
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
813 bp | 270 aa | 2095 | 2907 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MITVFCNDCHLSDDIPKLVADELLGIQQLDMLKARYKQMRKCYDFSYAEWQKEFSDDLKPFNGYTDTTSVCIPILNPLFRKDFTDKGAIGLDLPTWFNVQ
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Blast result :ORF 4
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
273 bp | 90 aa | 2915 | 3187 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MGCITFVLLVLNIIALVAIDIMFWAESAASGLAGVFGIIAFFIGYALSVEVTIAPRDFWVNSAFGIFIKKLGVANMTAFAVWFIGNLIIG
Blast result :ORF 5
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
762 bp | 253 aa | 3208 | 3969 | + | No |
Annotation : Hypothetical proteinDescription :
ORF sequence :
MSNNENSVLEYLKANNEVLFDKIVNALRKGKQVNFTDINQSDIIILSPQKAFEYAGEEGDKYFKVWMVGGTIAWCTWANSMVDSDFRWNAKARNENKRDN
KDILGNEPYVSAYLKSNSAIEQCSVVYMFPFEAFSQKKVEVVKKVEKIENTNKDENKTTDVQVKKLIDRLSHLVEDVAEYFAPAPPIPILGPLLKSMDEE
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DYRRCRTEFDTKLMRLKCLDEHNKMIPYFEKKAEEWDYKKAGLFGKIAKVLKK
Blast result :
Comments
ISBun2 is 60% aa similar to ISBun1. The first ORF is the transposase, the others are passengers genes.
References
1] Fulton,L., Clifton,S., Fulton,B., Xu,J., Minx,P., Mardis,E.R. and Wilson,R.K. (2007) Direct submission GenBank.