ISBun2

  • Family IS1595
  • Group ISNwi1
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
NZ_AAYH02000036 ND Bacteroides uniformis
Bacteroides uniformis ATCC 8492
DNA section
IS Length : 4739 bp

Ends


IR Length : 25/27

IRL : CCCAATTATATACTTTAATGTACTAATTTTAATTCTATCTATTTATATCT
IRR : CCCAATTATATACTTTAATGCACCAATCACACAAAAATAAAAGCCGCACC

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
ATGCCAAGAATATCTCTTTATTGGCATTGCTGG8

DNA sequence

CCCAATTATATACTTTAATGTACTAATTTTAATTCTATCTATTTATATCTTATTTCAATGGGGAAATCTTTTAGGTTTCCCTATTTTTTATGCCCGTTTT
CAAGTGAATCAAAACGTTAGTTCTGTTAAACTTTGTTTCTAATATCATAGATAATAGTCGAAATTCGATAAAAAAATCGGTTTTCAGTATCAGAAAACCG
ATTTATAAAGGTTAAATAATGCTCCTTTATGTAAATCAGCCAAATTTGGTAAAAAGCGGTAAATAAATACTGTAATCTCCTCAAATGGAGAGATTATAAT
TATGAAAAAATTAAAAGAATTGATTAGAACGCTTCACAGCGTTTTATGTTTTACAGTAAAAATCTACCAAATATTATACCGCATTTGGCTGATTAAGTCC
TTAATCGAATTGATTAAGGGAGATTGGTAAATTTGCATTAAGAACTTGATTGTTTACGGCAGTCAAGTTCTGTTTTTAACCGTGTTTTCAAGTGAATCAA
AGAATTTTGTTAAAGAATCCTAAGTAGATAACACTTGAGATTGGATTTGGGTATAATTCGCCAAAGTAGTTTTCATGGTAGTAAAAACCAAGTGTTCCAA
GTATCGTACTGGAAGCACTTGGTTAATGATTATAAATGAGCAATAATTACAGGATATATGTATATGATAATTATATCCAATTGTTTATTTAAGTATCTAA
TTTTTAATCACTTATGTTTTATATGTTAGGATTTTTTATTATATTTATATAATAAAAATAACATGTCAATTGGAAACAGAAATAATCAATATTGTAGAAA
TAATAAAGAAGAATAAACAAATGCGAGAAGTAAAGTCATTTATTGATTTGATGAAATCCTTTTATGATGAAAAATCATGCAGAGAATTTCTTGAAGATAT
TAAATGGCGTGGAGAACCGATTTGCCCACACTGTAATTGTCAAACGAAAGAGCATTATAAGTTAAAGTCTAATGGAGAATTTAAAGGACTATATAAATGT
AAACGATGTAAGAAAAGATTTACGGTTACTATTGGTACAATGTTTGAAGGTAGTCATGTGTCATTAAAGAAATGGTTCTATGCATTGTATATATTCTTAG
CCCATAAGAAAGGAATAAGTAGCATACAATTATCTAAGGATATAGATGTAACACAGAAAACAGCTTGGTTTATGTTGGAACGGATAAGACATAATTTGAA
AGACAAGCTTGTAGTTCAATTTAATGATATGACACAAGTTGATGAAACCTATGTCGGTGGTAAGAATAAAGGTAGAGTAAAGAATGCACAAGGAAGAAGC
CTTAAAGTAAAGACTCCCGTAGTAGGTCTATTATCTAATGGAATGGCCTATACAGCCGTTGTTCCAAATACCGGTGGAAAGGTTTTGAAAACGATAATCA
ATACTTTAGTCAAGGAAGGTTCTACCGTTATAACAGATGGATGGAAAGGTTATACTGGAATATCGAAAAATTATATTCATAAAGTAGTTGAACATAGTAC
TGGTGAATATGTAAAAGACGGATTCCATACCAATAGTATTGAAGGATTTTGGTCACACTTGAAACGTGGAATATTAGGAATATATCATAAAGTAAGTCCA
AAGCATTTGGATAAATACTGTGATGAATTTGCATTTAGATATAATACGAGAGGACTAACAGATGTTGAAAGATTTACTTATTTTACGATGTCAGCATATA
AAAGATTAAAGTATCAAAGTTTGATTTCCCCATAAGAATAGGTAAATTTGAATTGAAAATAGAAAAAGAGCAGTTCACGAAGTAGCATTTTTGCTAAATA
GTTCCTATATTTGCATTGTCCCAAGAGGGACAGACATAGTTTAGGAAGCGTTTAGCTTATTCCTTGTCAATGAATCTGGACAATTCACCTGCACTGAGGA
ATATGAAAGAATGCTCCCTTTGGTTTGCATATATAGCACTGATGTGTTGATATACAGCCAAAGGCGTGAGCTGTTTTCATTTTTCGGTGCAGAGGTAGTC
CAGAACCCATTGACGGAATTTGATAACAGTCTTGCGCCTTCCCTATTTTAGAAAATGCTTTCTTTGAGACTGGGGGAGCGCAAAGTGATTGTGTATGATA
ACAGTCTTCTGCAATGATTGTCATTTGTCGGATGATATTCCAAAGTTAGTTGCTGATGAATTGTTGGGTATTCAGCAATTAGATATGTTAAAGGCTCGTT
ATAAGCAAATGAGAAAGTGCTATGACTTCTCGTATGCAGAATGGCAAAAAGAGTTTTCCGATGATTTGAAGCCTTTTAATGGATATACAGATACTACCTC
TGTTTGTATTCCCATTTTGAATCCATTGTTTAGAAAAGATTTTACAGATAAAGGTGCAATAGGTTTGGATTTGCCGACTTGGTTTAATGTTCAAGTCGAT
AATGTCCGAATTATGCTTATTGCGCAAGACCCGTTACGTGATGCGAAATGGTATGAAGAATGCCATGATGCGATAGTATCAAGTCCATTTGGGCTGCATG
ATGCAACCCATAGAAAAAGTGGAAGTGGTGGTAAAATGGCAGATTTGTTGATTAATAGTCTGATTAAGAAAGAGTTTGCAATATACCTGACTGATGCGAA
TAAGTATTTTGTACATGATAGAGAAATGTCTAAAACCTGTTTAGAAAGTAAATTAGAGGTATATACTGATATATTGCAAAAAGAATTAGACTTAGTGAGA
CCAAATCTTTGTGTTTGTTTAGGTAAGAAAGCGAAAGAGGTTTTAGATAAATGTGTGGTAAATGCCAAATCAATAATGTTGCCGCATTTGTCGGGAACTG
CACGAGGAGCGATAGTCAAAAGGTTTCCAATATTAGAAGATATTAAAGCAACAACTGAAAATGTTGCAAATGTATATGTAGATGAAATTGTTGAATCATT
AAAATAGTAGAATTATGGGTTGTATAACATTCGTATTGTTAGTATTGAATATCATTGCATTAGTTGCAATAGATATTATGTTTTGGGCTGAAAGTGCAGC
TTCGGGACTTGCTGGAGTATTTGGTATTATAGCATTCTTTATAGGATATGCTTTGAGTGTGGAAGTAACGATTGCCCCAAGAGATTTTTGGGTAAATTCT
GCATTCGGTATCTTTATAAAGAAACTTGGTGTAGCCAATATGACAGCTTTTGCAGTGTGGTTTATCGGAAATTTGATAATTGGGTAGAAACATTAAAATG
AGAAGATATGAGCAATAATGAAAATTCAGTTTTAGAGTATTTGAAAGCAAACAATGAAGTATTGTTTGATAAAATCGTGAATGCTTTGCGTAAAGGAAAG
CAAGTTAATTTTACGGATATTAATCAAAGTGATATTATCATTTTGAGTCCGCAGAAAGCATTTGAATATGCGGGAGAAGAAGGCGATAAGTATTTTAAAG
TTTGGATGGTAGGGGGTACTATTGCTTGGTGTACTTGGGCTAATTCAATGGTTGATAGCGATTTCCGTTGGAATGCTAAGGCGAGAAATGAAAACAAAAG
AGATAATAAGGACATTTTGGGTAATGAGCCTTATGTTTCTGCTTATTTGAAGTCTAATTCTGCCATTGAACAATGTTCAGTAGTTTATATGTTCCCGTTT
GAAGCTTTTTCCCAAAAGAAGGTAGAAGTTGTGAAGAAGGTGGAAAAGATAGAGAATACAAATAAAGATGAAAATAAAACAACCGATGTACAAGTAAAAA
AACTGATAGACAGACTTTCCCATTTGGTAGAAGATGTAGCAGAATATTTTGCACCTGCTCCTCCTATACCTATATTAGGCCCATTGTTGAAGTCAATGGA
TGAAGAAGATTATCGTAGGTGTCGGACTGAATTTGATACTAAATTGATGAGATTGAAATGTCTGGATGAGCACAATAAGATGATACCGTATTTTGAAAAG
AAAGCAGAAGAATGGGATTATAAAAAAGCTGGACTATTTGGAAAAATAGCTAAAGTGTTGAAGAAATGATTTGAATATAGAGAATTTTGGCAAGACCGTA
TCAAAGTATAAGTATTGAGATACGGTCTTGTTTTATACATATATAAATCATAAATTGAAATACAGATTTATGTGTAAAGAAAGATTCCTAATATCCCCCC
CCCCATTTAGGTAATCAAGTGACGAAATCCACCATTGGTGTACCACCTCGTAAATGTGTTAAACATCTTAAAGGAAATTGTAAAATCCTGAGCAGGAAGG
AGGCACATTATGGCTTGGAATGATTTGGCATCAAATGAGTGTCCTACAAAAGCGGATATAAATGCAAGATTTAAAGAATACTTGAATTGGCAATCACGTA
GTATTACTTTTGATAATTCTGATTATACCGTAAACCCTGGTGGAGCACCTTGGAATTATTTGTTTATATGGATAGAAAATACAATTTCAGAATGGAATAA
TAGAACTCCATATATACCAATACCGTCATGTTTATTAATTCCTAAAGCTGATAATGGTGCTGTTATGACATTTGATATAAAGATTTATGATGTTGAGTTT
ACGTTAAAAAAACTTGAGCTAAAAAATACACTTAAGGTTAGTTTTAATGGTACAACAGGTGATATAAGATTGCAAAAAGAAAATGCTAATATAACTTGTT
ATTTTAACTATATTGTTTTCTGTTAGTATGAATTAATAATATGGATATAATAAATTTTTCTAAAATAGCCGCACCTAAGTTTGAATTTGGGTGCGGCTTT
TATTTTTGTGTGATTGGTGCATTAAAGTATATAATTGGG
Protein section
ORF number : 5

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
966 bp321 aa7701735+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

METEIINIVEIIKKNKQMREVKSFIDLMKSFYDEKSCREFLEDIKWRGEPICPHCNCQTKEHYKLKSNGEFKGLYKCKRCKKRFTVTIGTMFEGSHVSLK
KWFYALYIFLAHKKGISSIQLSKDIDVTQKTAWFMLERIRHNLKDKLVVQFNDMTQVDETYVGGKNKGRVKNAQGRSLKVKTPVVGLLSNGMAYTAVVPN
TGGKVLKTIINTLVKEGSTVITDGWKGYTGISKNYIHKVVEHSTGEYVKDGFHTNSIEGFWSHLKRGILGIYHKVSPKHLDKYCDEFAFRYNTRGLTDVE
RFTYFTMSAYKRLKYQSLISP

 

Blast result :
ORF 2
LengthBeginEndStrandFusion ORF
108 bp35 aa19442051+No
ORF function : Passenger Gene
Annotation : Hypothetical proteinDescription :

ORF sequence :

MLIYSQRRELFSFFGAEVVQNPLTEFDNSLAPSLF

 

Blast result :
ORF 3
LengthBeginEndStrandFusion ORF
813 bp270 aa20952907+No
ORF function : Passenger Gene
Annotation : Hypothetical proteinDescription :

ORF sequence :

MITVFCNDCHLSDDIPKLVADELLGIQQLDMLKARYKQMRKCYDFSYAEWQKEFSDDLKPFNGYTDTTSVCIPILNPLFRKDFTDKGAIGLDLPTWFNVQ
VDNVRIMLIAQDPLRDAKWYEECHDAIVSSPFGLHDATHRKSGSGGKMADLLINSLIKKEFAIYLTDANKYFVHDREMSKTCLESKLEVYTDILQKELDL
VRPNLCVCLGKKAKEVLDKCVVNAKSIMLPHLSGTARGAIVKRFPILEDIKATTENVANVYVDEIVESLK

 

Blast result :
ORF 4
LengthBeginEndStrandFusion ORF
273 bp90 aa29153187+No
ORF function : Passenger Gene
Annotation : Hypothetical proteinDescription :

ORF sequence :

MGCITFVLLVLNIIALVAIDIMFWAESAASGLAGVFGIIAFFIGYALSVEVTIAPRDFWVNSAFGIFIKKLGVANMTAFAVWFIGNLIIG

 

Blast result :
ORF 5
LengthBeginEndStrandFusion ORF
762 bp253 aa32083969+No
ORF function : Passenger Gene
Annotation : Hypothetical proteinDescription :

ORF sequence :

MSNNENSVLEYLKANNEVLFDKIVNALRKGKQVNFTDINQSDIIILSPQKAFEYAGEEGDKYFKVWMVGGTIAWCTWANSMVDSDFRWNAKARNENKRDN
KDILGNEPYVSAYLKSNSAIEQCSVVYMFPFEAFSQKKVEVVKKVEKIENTNKDENKTTDVQVKKLIDRLSHLVEDVAEYFAPAPPIPILGPLLKSMDEE
DYRRCRTEFDTKLMRLKCLDEHNKMIPYFEKKAEEWDYKKAGLFGKIAKVLKK

 

Blast result :
Comments
ISBun2 is 60% aa similar to ISBun1. The first ORF is the transposase, the others are passengers genes.
References
1] Fulton,L., Clifton,S., Fulton,B., Xu,J., Minx,P., Mardis,E.R. and Wilson,R.K. (2007) Direct submission GenBank.