ISSha1
- Family ISL3
- Group
Isoform Synonym(s)
| Accession number | Transposition | Origin | Host |
|---|---|---|---|
| NC_007168 | ND | Staphylococcus haemolyticus | Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 |
DNA section
IS Length : 1489 bp
Ends
IR Length : 22/26
IRL : GGCTCTATAATAAATTGGACTGATGACTAAAAAATCATCAGTCCAATTTT
IRR : GGCTCTACGTCAAATCGGACTGATGAGTCCAAATATTGAGATTAAGCAAC
Insertion site
| Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
|---|---|---|---|
| CTATTAAACCTA | ATATTTTT | CCAGAAGATAAT | 8 |
DNA sequence
GGCTCTATAATAAATTGGACTGATGACTAAAAAATCATCAGTCCAATTTTTATGTTTGAATACAAAAATGGCGCAATTACCTCTATAATTATTAGCTACC
AAACAAAATAAAAAAGAAAGGTAATGCGCCTATGTGTATGTCTATATTAAATACATTAAGAATTAAAGATAAAAATCTAAATTTTTCAGATGAAGTGATT
GAGAAAAAACATAAAGGACGAATGAGCTTGTTTTACTATGCCGAGCTCACTTATCAACCTACACATTGTGAAAATTGTTCAACTAAAAATGAAAATTTCT
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TTTGCCTCAACAACAAAAAAAGAGATTAAACAACCTAAGGTTGCTTAATCTCAATATTTGGACTCATCAGTCCGATTTGACGTAGAGCC
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
| Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1317 bp | 438 aa | 132 | 1448 | + | No |
Chemistry : Unknow
ORF sequence :
MCMSILNTLRIKDKNLNFSDEVIEKKHKGRMSLFYYAELTYQPTHCENCSTKNENFSIVKNGKKTSTITLLKIMEMPTYLKLQKQRFYCKSCDSHFTAKS
NIVDAHCFISNKTKLAVLDKAQEYRSQKSIAKSCLVSSMTVSRVINQAASDIGQSSFDALPEHLMMDEFKSVKNVIGKMSFIYADAVSHRIVDVVADRKL
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Blast result :
Comments
ISSha1 is 60% aa similar to IS1181.There are 28 full copies in the genome of Staphylococcus haemolyticus JSCS1435.
References
1] Takeuchi,F., Watanabe,S., Baba,T., Yuzawa,H., Ito,T., Morimoto,Y., Kuroda,M., Cui,L., Takahashi,M., Ankai,A., Baba,S., Fukui,S., Lee,J.C. and Hiramatsu,K. (2005) J. Bacteriol. 187 (21), 7292-7308