ISNpu2
- Family IS630
- Group
Isoform Synonym(s)
Accession number | Transposition | Origin | Host |
---|---|---|---|
NZ_AAAY02000032.1 | ND | Nostoc punctiforme | Nostoc punctiforme |
DNA section
IS Length : 1220 bp
Ends
IR Length : 22/28
IRL : AGCTAATCGGCACATAAGTTGCATAATAAGAAGATGAAGCCGTTCAAAAG
IRR : AGCTAATCAGCATTTAAGCTGCAACATAGTGGATATTGCCTTTATTTCTT
Insertion site
Left flank | Direct repeat | Right flank | DR Length |
---|---|---|---|
ATAACTAGAA | TA | CCAGTTAAATGCTGAA | 2 |
DNA sequence
AGCTAATCGGCACATAAGTTGCATAATAAGAAGATGAAGCCGTTCAAAAGCAACTATGCCGCCACCAGCCAAGAATTTTTTAACTACGGAACAAGTTAGT
AAGTTACAGCAAGCTCTAAAAGAGAGCGAGCTACCCCACGTCAGGGAAAGAATTCTAATTATTTTGCTCCAAAACGATGGGAAACCGCAACAGGAAACTG
CTAAATTTTTAGGCTGTTCGCGCAGAACAGTGGCATATTGGTGTATGCACGGTGATCCAGATGATCTAGAAACTCTACATAATAAAAGAGAGTACGAACA
TTATCGAAAAGCTACTCCTGAATATATTGAACTGTTATTAAAAACTGTTGACCAAGAGCCATCAGATTTAGGCTACGACTTTGGCAGATGGACGGCAGAA
AGATTAGCCACATATTTAACCCAGAAAACAGGGATTGATTTAAGTAGTTCTCAGTTAAGGAGGATATTAAAGCGAAAAAAGTATAGTTATATCTGGGCTA
AATATGACCTAGAAGATAAACAAAATCCAATTGAAAGAGCGAAGTTTAAAGAGAAACTTACTCAATATTTATCAATAGCACGAGAACAGCCAGAGCGTTT
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GGAAAACGCAAGAATGTTCCAGGAGAACGGCGTTGTGGTCGAGTAAATGTCATGGGGGCAATCAGAGAGCTAGACCGGAAACGCGTATGCTTTTTTGTAA
AAAAGGGAAACGCAGATATTTTTTATGAGCAATTACAACAATTAAATGGACTAATAAAACAAGAATGGGTTAGTATTGGAAACCGTTTTGAAGATTTTGC
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TTAGAGTTTTTACCTGCTTACAGCCCAGATTACAACATCATCGAATTAGTTTGGCATTCATGTAAAGAATATATTGCTCACCGTCTATTTAAATTAGTGG
ATGAATTAAAATCATTACTAGATAAGTTGTTAAATCAAGGTGAGTTAGTAATTAAGTGGCATCGGAAAATAAGAAATAAAGGCAATATCCACTATGTTGC
AGCTTAAATGCTGATTAGCT
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ATGAATTAAAATCATTACTAGATAAGTTGTTAAATCAAGGTGAGTTAGTAATTAAGTGGCATCGGAAAATAAGAAATAAAGGCAATATCCACTATGTTGC
AGCTTAAATGCTGATTAGCT
Protein section
ORF number : 1
ORF 1
Length | Begin | End | Strand | Fusion ORF | |
---|---|---|---|---|---|
1152 bp | 383 aa | 56 | 1207 | + | No |
Chemistry : DDE
ORF sequence :
MPPPAKNFLTTEQVSKLQQALKESELPHVRERILIILLQNDGKPQQETAKFLGCSRRTVAYWCMHGDPDDLETLHNKREYEHYRKATPEYIELLLKTVDQ
EPSDLGYDFGRWTAERLATYLTQKTGIDLSSSQLRRILKRKKYSYIWAKYDLEDKQNPIERAKFKEKLTQYLSIAREQPERFQVWFWDVSVAGARTRATS
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KDVLTKISQEFPNFVLEFLPAYSPDYNIIELVWHSCKEYIAHRLFKLVDELKSLLDKLLNQGELVIKWHRKIRNKGNIHYVAA
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Blast result :
Comments
ISNpu2 is 37% aa similar ISPlu16.
References
1] NCBI Microbial Genomes Annotation Project (2004) Direct submission to Genbank.